ROBUST QUANTIFICATION OF SINGLE MOLECULES IN NEXT-GENERATION SEQUENCING USING NON-RANDOM COMBINATORIAL OLIGONUCLEOTIDE BARCODES

A population of nucleic acid adaptors is provided. In some embodiments, the population contains at least 50,000 different molecular barcode sequences, where the barcode sequences are double-stranded and at least 90% of the barcode sequences have an edit distance of at least 2. In certain cases, the...

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Hauptverfasser: JI, Hanlee P, LAU, Billy Tsz Cheong
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator JI, Hanlee P
LAU, Billy Tsz Cheong
description A population of nucleic acid adaptors is provided. In some embodiments, the population contains at least 50,000 different molecular barcode sequences, where the barcode sequences are double-stranded and at least 90% of the barcode sequences have an edit distance of at least 2. In certain cases, the adaptor may have an end in which the top and bottom strands are not complementary (i.e., may be in the form of a Y-adaptor). In some embodiments and depending on the how the adaptor is going to be employed, the other end of the adaptor may have a ligatable end or may be a transposon end sequence. La présente invention concerne une population d'adaptateurs d'acide nucléique. Dans certains modes de réalisation, ladite population contient au moins 50 000 séquences de codes à barres moléculaires différentes, les séquences de codes à barres étant à double brin et au moins 90 % des séquences de codes à barres ayant une distance d'édition d'au moins 2. Dans certains cas, l'adaptateur peut avoir une extrémité dans laquelle les brins supérieur et inférieur ne sont pas complémentaires, c'est-à-dire, qu'il peut être en forme de Y. Dans certains modes de réalisation, et selon la manière dont l'adaptateur est destiné à être utilisé, l'autre extrémité de l'adaptateur peut avoir une extrémité ligaturable ou peut être une séquence d'extrémité de transposon.
format Patent
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Dans certains cas, l'adaptateur peut avoir une extrémité dans laquelle les brins supérieur et inférieur ne sont pas complémentaires, c'est-à-dire, qu'il peut être en forme de Y. 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