MEDICAL PROGNOSIS AND PREDICTION OF TREATMENT RESPONSE USING MULTIPLE CELLULAR SIGNALING PATHWAY ACTIVITIES

The present application mainly relates to specific method for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event within a definedn period of time. The risk score is determined based on a combination of inferred activities of two or more cellular signaling...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: VAN GOG, ROBERT, WROBEL, JANNEKE, VAN BRUSSEL, ANNE GODEFRIDA CATHARINA, VERHAEGH, WILHELMUS FRANCISCUS JOHANNES, VAN OOIJEN, HENDRIK JAN
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator VAN GOG, ROBERT
WROBEL, JANNEKE
VAN BRUSSEL, ANNE GODEFRIDA CATHARINA
VERHAEGH, WILHELMUS FRANCISCUS JOHANNES
VAN OOIJEN, HENDRIK JAN
description The present application mainly relates to specific method for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event within a definedn period of time. The risk score is determined based on a combination of inferred activities of two or more cellular signaling pathways in a subject, wherein the cellular signaling pathways comprise a PI3K pathway and one or more of a Wnt pathway, an ER pathway, and an HH pathway. The present application also relates to an apparatus, to a non-transitory storage medium, and to a computer program for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event within a definedn period of time. The present invention also relates to a kit for measuring expression levels of three or more target genes of each of two or more cellular signaling pathways in a sample of a subject, to kits for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event associated with a disease within a defined period of time, and to uses of the kits in performing the method. La présente invention concerne principalement un procédé spécifique pour déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. Le score de risque est déterminé en fonction d'une combinaison des activités inférées d'au moins deux voies de signalisation cellulaire chez un sujet, où les voies de signalisation cellulaire comprennent une voie PI3K et une ou plusieurs voies parmi une voie Wnt, une voie ER et une voie HH. La présente invention concerne également un appareil, un support de stockage non transitoire, et un programme informatique permettant de déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. La présente invention concerne également un kit pour la mesure des niveaux d'expression d'au moins trois gènes cibles de chaque voie parmi deux ou plusieurs voies de signalisation cellulaire dans un échantillon d'un sujet, et des kits permettant de déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique associé à une maladie durant une période de temps définie, et des utilisations des kits pour la mise en œuvre du procédé.
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The risk score is determined based on a combination of inferred activities of two or more cellular signaling pathways in a subject, wherein the cellular signaling pathways comprise a PI3K pathway and one or more of a Wnt pathway, an ER pathway, and an HH pathway. The present application also relates to an apparatus, to a non-transitory storage medium, and to a computer program for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event within a definedn period of time. The present invention also relates to a kit for measuring expression levels of three or more target genes of each of two or more cellular signaling pathways in a sample of a subject, to kits for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event associated with a disease within a defined period of time, and to uses of the kits in performing the method. La présente invention concerne principalement un procédé spécifique pour déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. Le score de risque est déterminé en fonction d'une combinaison des activités inférées d'au moins deux voies de signalisation cellulaire chez un sujet, où les voies de signalisation cellulaire comprennent une voie PI3K et une ou plusieurs voies parmi une voie Wnt, une voie ER et une voie HH. La présente invention concerne également un appareil, un support de stockage non transitoire, et un programme informatique permettant de déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. La présente invention concerne également un kit pour la mesure des niveaux d'expression d'au moins trois gènes cibles de chaque voie parmi deux ou plusieurs voies de signalisation cellulaire dans un échantillon d'un sujet, et des kits permettant de déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique associé à une maladie durant une période de temps définie, et des utilisations des kits pour la mise en œuvre du procédé.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATIONTECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING ORPROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA ; INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTEDFOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PHYSICS ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2016</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160428&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2016062892A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,776,881,25543,76293</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160428&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2016062892A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>VAN GOG, ROBERT</creatorcontrib><creatorcontrib>WROBEL, JANNEKE</creatorcontrib><creatorcontrib>VAN BRUSSEL, ANNE GODEFRIDA CATHARINA</creatorcontrib><creatorcontrib>VERHAEGH, WILHELMUS FRANCISCUS JOHANNES</creatorcontrib><creatorcontrib>VAN OOIJEN, HENDRIK JAN</creatorcontrib><title>MEDICAL PROGNOSIS AND PREDICTION OF TREATMENT RESPONSE USING MULTIPLE CELLULAR SIGNALING PATHWAY ACTIVITIES</title><description>The present application mainly relates to specific method for determining a risk score that indicates a risk that a subject will experience a clinical event within a definedn period of time. 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La présente invention concerne principalement un procédé spécifique pour déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. Le score de risque est déterminé en fonction d'une combinaison des activités inférées d'au moins deux voies de signalisation cellulaire chez un sujet, où les voies de signalisation cellulaire comprennent une voie PI3K et une ou plusieurs voies parmi une voie Wnt, une voie ER et une voie HH. La présente invention concerne également un appareil, un support de stockage non transitoire, et un programme informatique permettant de déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. 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La présente invention concerne principalement un procédé spécifique pour déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. Le score de risque est déterminé en fonction d'une combinaison des activités inférées d'au moins deux voies de signalisation cellulaire chez un sujet, où les voies de signalisation cellulaire comprennent une voie PI3K et une ou plusieurs voies parmi une voie Wnt, une voie ER et une voie HH. La présente invention concerne également un appareil, un support de stockage non transitoire, et un programme informatique permettant de déterminer un score de risque qui indique un risque qu'un sujet subisse un événement clinique durant une période de temps définie. 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