HIV-2 NUCLEIC ACIDS AND METHODS OF DETECTION

Disclosed herein are methods of detecting HIV-2 nucleic acids in a sample (such as from a sample infected with or suspected to be infected with HIV-2). In some examples, the methods include LAMP or RT-LAMP, while in other examples, the methods include hybridization of a probe to an HIV-2 nucleic aci...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: RUDOLPH, Donna, L, YOUNGPAIROJ, Ae, S, NIEDZWIEDZ, Philip, CURTIS, Kelly, A, OWEN, Sherry, M, PAU, Chou-pong, GRANADE, Timothy, C
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator RUDOLPH, Donna, L
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GRANADE, Timothy, C
description Disclosed herein are methods of detecting HIV-2 nucleic acids in a sample (such as from a sample infected with or suspected to be infected with HIV-2). In some examples, the methods include LAMP or RT-LAMP, while in other examples, the methods include hybridization of a probe to an HIV-2 nucleic acid, including, but not limited to real-time PCR. Sets of LAMP primers for detection of HIV-2 Group A and Group B nucleic acids are provided herein. Sets of probes and primers for real-time PCR detection of HIV-2 nucleic acids are also provided herein. Finally, primers for amplification of HIV-2 nucleic acids are provided. Also disclosed are isolated HIV-2 nucleic acids, vectors including the HIV-2 nucleic acids, and cells transformed with vectors including HIV-2 nucleic acids. L'invention concerne des procédés de détection d'acides nucléiques du VIH-2 dans un échantillon (par exemple un échantillon infecté par le VIH-2 ou suspecté de l'être). Dans certains exemples, lesdits procédés comprennent une amplification LAMP ou RT-LAMP, tandis que, dans d'autres exemples, les procédés impliquent l'hybridation d'une sonde à un acide nucléique du VIH-2, pouvant intervenir, par exemple, mais la liste n'est pas limitative, dans le cadre d'une PCR en temps réel. L'invention concerne également des ensembles d'amorces pour amplification LAMP permettant la détection des acides nucléiques des groupes A et B du VIH-2. L'invention concerne, en outre, des ensembles de sondes et d'amorces pour la détection par PCR en temps réel d'acides nucléiques du VIH-2. Enfin, l'invention concerne des amorces pour l'amplification d'acides nucléiques du VIH-2. L'invention concerne encore des acides nucléiques isolés du VIH-2, des vecteurs comportant des acides nucléiques du VIH-2, et des cellules transformées au moyen de vecteurs comportant des acides nucléiques du VIH-2.
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In some examples, the methods include LAMP or RT-LAMP, while in other examples, the methods include hybridization of a probe to an HIV-2 nucleic acid, including, but not limited to real-time PCR. Sets of LAMP primers for detection of HIV-2 Group A and Group B nucleic acids are provided herein. Sets of probes and primers for real-time PCR detection of HIV-2 nucleic acids are also provided herein. Finally, primers for amplification of HIV-2 nucleic acids are provided. Also disclosed are isolated HIV-2 nucleic acids, vectors including the HIV-2 nucleic acids, and cells transformed with vectors including HIV-2 nucleic acids. L'invention concerne des procédés de détection d'acides nucléiques du VIH-2 dans un échantillon (par exemple un échantillon infecté par le VIH-2 ou suspecté de l'être). Dans certains exemples, lesdits procédés comprennent une amplification LAMP ou RT-LAMP, tandis que, dans d'autres exemples, les procédés impliquent l'hybridation d'une sonde à un acide nucléique du VIH-2, pouvant intervenir, par exemple, mais la liste n'est pas limitative, dans le cadre d'une PCR en temps réel. L'invention concerne également des ensembles d'amorces pour amplification LAMP permettant la détection des acides nucléiques des groupes A et B du VIH-2. L'invention concerne, en outre, des ensembles de sondes et d'amorces pour la détection par PCR en temps réel d'acides nucléiques du VIH-2. Enfin, l'invention concerne des amorces pour l'amplification d'acides nucléiques du VIH-2. 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Dans certains exemples, lesdits procédés comprennent une amplification LAMP ou RT-LAMP, tandis que, dans d'autres exemples, les procédés impliquent l'hybridation d'une sonde à un acide nucléique du VIH-2, pouvant intervenir, par exemple, mais la liste n'est pas limitative, dans le cadre d'une PCR en temps réel. L'invention concerne également des ensembles d'amorces pour amplification LAMP permettant la détection des acides nucléiques des groupes A et B du VIH-2. L'invention concerne, en outre, des ensembles de sondes et d'amorces pour la détection par PCR en temps réel d'acides nucléiques du VIH-2. Enfin, l'invention concerne des amorces pour l'amplification d'acides nucléiques du VIH-2. 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In some examples, the methods include LAMP or RT-LAMP, while in other examples, the methods include hybridization of a probe to an HIV-2 nucleic acid, including, but not limited to real-time PCR. Sets of LAMP primers for detection of HIV-2 Group A and Group B nucleic acids are provided herein. Sets of probes and primers for real-time PCR detection of HIV-2 nucleic acids are also provided herein. Finally, primers for amplification of HIV-2 nucleic acids are provided. Also disclosed are isolated HIV-2 nucleic acids, vectors including the HIV-2 nucleic acids, and cells transformed with vectors including HIV-2 nucleic acids. L'invention concerne des procédés de détection d'acides nucléiques du VIH-2 dans un échantillon (par exemple un échantillon infecté par le VIH-2 ou suspecté de l'être). Dans certains exemples, lesdits procédés comprennent une amplification LAMP ou RT-LAMP, tandis que, dans d'autres exemples, les procédés impliquent l'hybridation d'une sonde à un acide nucléique du VIH-2, pouvant intervenir, par exemple, mais la liste n'est pas limitative, dans le cadre d'une PCR en temps réel. L'invention concerne également des ensembles d'amorces pour amplification LAMP permettant la détection des acides nucléiques des groupes A et B du VIH-2. L'invention concerne, en outre, des ensembles de sondes et d'amorces pour la détection par PCR en temps réel d'acides nucléiques du VIH-2. Enfin, l'invention concerne des amorces pour l'amplification d'acides nucléiques du VIH-2. L'invention concerne encore des acides nucléiques isolés du VIH-2, des vecteurs comportant des acides nucléiques du VIH-2, et des cellules transformées au moyen de vecteurs comportant des acides nucléiques du VIH-2.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
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