HIGHLY SENSITIVE MUTATED GENE DETECTION METHOD

Disclosed are various highly sensitive detection methods, particularly improved PNA-LNA-PCR clamp methods, as methods for detecting the presence or absence of a mutated gene included in a gene pool rapidly, in a simple manner, with high accuracy, and with high sensitivity. As a previous step for the...

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Hauptverfasser: MATSUMOTO HIDEO, OHIDE AKIRA, MATSUDA KOUICHIROU, FUJIMOTO HIDEYA
Format: Patent
Sprache:eng ; fre ; jpn
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creator MATSUMOTO HIDEO
OHIDE AKIRA
MATSUDA KOUICHIROU
FUJIMOTO HIDEYA
description Disclosed are various highly sensitive detection methods, particularly improved PNA-LNA-PCR clamp methods, as methods for detecting the presence or absence of a mutated gene included in a gene pool rapidly, in a simple manner, with high accuracy, and with high sensitivity. As a previous step for the main detection step, a previous amplification step is carried out, wherein the previous amplification step comprises allowing (1) a clamp primer which comprises a PNA that can hybridize with the entire region or a part of a target site comprising the sequence for wild-type gene or a sequence complementary to the wild-type gene, (2) a primer which can amplify a region containing a target site comprising the sequence for the mutated gene, and (3) the gene pool to coexist in a reaction solution for a gene amplification reaction and selectively amplifying the region containing the target site of the mutated gene by a gene amplification method. L'invention concerne divers procédés de détection très sensibles, en particulier des procédés de PNA-LNA-PCR clamp améliorés, comme procédés de détection de la présence ou de l'absence d'un gène muté compris dans un pool de gènes, rapidement, simplement, avec une précision élevée et une sensibilité élevée. En tant qu'étape préalable à l'étape de détection principale, une étape d'amplification préalable est mise en oeuvre, l'étape d'amplification préalable consistant à laisser coexister (1) une amorce clamp qui comprend un PNA qui peut s'hybrider avec la totalité de la région ou une partie d'un site cible comprenant la séquence du gène sauvage ou une séquence complémentaire du gène sauvage, (2) une amorce qui peut amplifier une région contenant un site cible comprenant la séquence pour le gène muté, et (3) le pool de gènes, dans une solution réactionnelle pour une réaction d'amplification de gène, et à amplifier sélectivement la région contenant le site cible du gène muté par une méthode d'amplification de gène.
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As a previous step for the main detection step, a previous amplification step is carried out, wherein the previous amplification step comprises allowing (1) a clamp primer which comprises a PNA that can hybridize with the entire region or a part of a target site comprising the sequence for wild-type gene or a sequence complementary to the wild-type gene, (2) a primer which can amplify a region containing a target site comprising the sequence for the mutated gene, and (3) the gene pool to coexist in a reaction solution for a gene amplification reaction and selectively amplifying the region containing the target site of the mutated gene by a gene amplification method. L'invention concerne divers procédés de détection très sensibles, en particulier des procédés de PNA-LNA-PCR clamp améliorés, comme procédés de détection de la présence ou de l'absence d'un gène muté compris dans un pool de gènes, rapidement, simplement, avec une précision élevée et une sensibilité élevée. En tant qu'étape préalable à l'étape de détection principale, une étape d'amplification préalable est mise en oeuvre, l'étape d'amplification préalable consistant à laisser coexister (1) une amorce clamp qui comprend un PNA qui peut s'hybrider avec la totalité de la région ou une partie d'un site cible comprenant la séquence du gène sauvage ou une séquence complémentaire du gène sauvage, (2) une amorce qui peut amplifier une région contenant un site cible comprenant la séquence pour le gène muté, et (3) le pool de gènes, dans une solution réactionnelle pour une réaction d'amplification de gène, et à amplifier sélectivement la région contenant le site cible du gène muté par une méthode d'amplification de gène.</description><language>eng ; fre ; jpn</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; COMPOSITIONS THEREOF ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; CULTURE MEDIA ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MICROORGANISMS OR ENZYMES ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2012</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20120105&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2012002477A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,776,881,25543,76294</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20120105&amp;DB=EPODOC&amp;CC=WO&amp;NR=2012002477A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>MATSUMOTO HIDEO</creatorcontrib><creatorcontrib>OHIDE AKIRA</creatorcontrib><creatorcontrib>MATSUDA KOUICHIROU</creatorcontrib><creatorcontrib>FUJIMOTO HIDEYA</creatorcontrib><title>HIGHLY SENSITIVE MUTATED GENE DETECTION METHOD</title><description>Disclosed are various highly sensitive detection methods, particularly improved PNA-LNA-PCR clamp methods, as methods for detecting the presence or absence of a mutated gene included in a gene pool rapidly, in a simple manner, with high accuracy, and with high sensitivity. 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En tant qu'étape préalable à l'étape de détection principale, une étape d'amplification préalable est mise en oeuvre, l'étape d'amplification préalable consistant à laisser coexister (1) une amorce clamp qui comprend un PNA qui peut s'hybrider avec la totalité de la région ou une partie d'un site cible comprenant la séquence du gène sauvage ou une séquence complémentaire du gène sauvage, (2) une amorce qui peut amplifier une région contenant un site cible comprenant la séquence pour le gène muté, et (3) le pool de gènes, dans une solution réactionnelle pour une réaction d'amplification de gène, et à amplifier sélectivement la région contenant le site cible du gène muté par une méthode d'amplification de gène.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>COMPOSITIONS THEREOF</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>CULTURE MEDIA</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MICROORGANISMS OR ENZYMES</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2012</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZNDz8HT38IlUCHb1C_YM8QxzVfANDXEMcXVRcHf1c1VwcQ1xdQ7x9PdT8HUN8fB34WFgTUvMKU7lhdLcDMpuriHOHrqpBfnxqcUFicmpeakl8eH-RgaGRgYGRibm5o6GxsSpAgCA1iap</recordid><startdate>20120105</startdate><enddate>20120105</enddate><creator>MATSUMOTO HIDEO</creator><creator>OHIDE AKIRA</creator><creator>MATSUDA KOUICHIROU</creator><creator>FUJIMOTO HIDEYA</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20120105</creationdate><title>HIGHLY SENSITIVE MUTATED GENE DETECTION METHOD</title><author>MATSUMOTO HIDEO ; OHIDE AKIRA ; MATSUDA KOUICHIROU ; FUJIMOTO HIDEYA</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO2012002477A13</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre ; jpn</language><creationdate>2012</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>COMPOSITIONS THEREOF</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>CULTURE MEDIA</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MICROORGANISMS OR ENZYMES</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>MATSUMOTO HIDEO</creatorcontrib><creatorcontrib>OHIDE AKIRA</creatorcontrib><creatorcontrib>MATSUDA KOUICHIROU</creatorcontrib><creatorcontrib>FUJIMOTO HIDEYA</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>MATSUMOTO HIDEO</au><au>OHIDE AKIRA</au><au>MATSUDA KOUICHIROU</au><au>FUJIMOTO HIDEYA</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>HIGHLY SENSITIVE MUTATED GENE DETECTION METHOD</title><date>2012-01-05</date><risdate>2012</risdate><abstract>Disclosed are various highly sensitive detection methods, particularly improved PNA-LNA-PCR clamp methods, as methods for detecting the presence or absence of a mutated gene included in a gene pool rapidly, in a simple manner, with high accuracy, and with high sensitivity. As a previous step for the main detection step, a previous amplification step is carried out, wherein the previous amplification step comprises allowing (1) a clamp primer which comprises a PNA that can hybridize with the entire region or a part of a target site comprising the sequence for wild-type gene or a sequence complementary to the wild-type gene, (2) a primer which can amplify a region containing a target site comprising the sequence for the mutated gene, and (3) the gene pool to coexist in a reaction solution for a gene amplification reaction and selectively amplifying the region containing the target site of the mutated gene by a gene amplification method. L'invention concerne divers procédés de détection très sensibles, en particulier des procédés de PNA-LNA-PCR clamp améliorés, comme procédés de détection de la présence ou de l'absence d'un gène muté compris dans un pool de gènes, rapidement, simplement, avec une précision élevée et une sensibilité élevée. 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