COMPOSITION, METHOD AND KIT FOR DETECTING FUNGI AND YEASTS BY MEANS OF SEQUENCING

The present invention describes a method for detecting the presence and type of fungi and/or yeasts in a sample by means of the techniques of amplification and sequencing of the 18S ribosomal RNA region and subsequent analysis of the sequences. The PCR primers hybridize in a conserved region specifi...

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Hauptverfasser: CASTAN GARCIA, PABLO, MINGORANCE CRUZ, JESUS, FRANCO DE SARABIA ROSADO, PEDRO MANUEL
Format: Patent
Sprache:eng ; fre ; spa
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creator CASTAN GARCIA, PABLO
MINGORANCE CRUZ, JESUS
FRANCO DE SARABIA ROSADO, PEDRO MANUEL
description The present invention describes a method for detecting the presence and type of fungi and/or yeasts in a sample by means of the techniques of amplification and sequencing of the 18S ribosomal RNA region and subsequent analysis of the sequences. The PCR primers hybridize in a conserved region specific for fungi, whilst the amplified zone has taxonomic value. The reagents required for performing the PCR and also the sequencing are presented as a gelled reaction mixture with trehalose, melezitose, glycogen or rafinose, and lysine or betaine. La presente invención, describe un método para detectar la presencia y tipo de hongos y/o levaduras que se encuentran en una muestra, mediante las técnicas de amplificación y secuenciación de la región del ARN ribosómico 18S, y posterior análisis de las secuencias. Los cebadores de la PCR hibridan en una región conservada específica de hongos, mientras que la zona amplificada tiene valor taxonómico. Los reactivos necesarios para realizar tanto la PCR como la secuenciación, se presentan en una mezcla de reacción gelificada con trehalosa, melezitosa, glucógeno o rafinosa, y lisina o betaína. La présente invention concerne un procédé pour détecter la présence et un type de champignons et/ou levures qui se trouvent dans un échantillon, par des techniques d'amplification et de séquençage de la région de l'ARN ribosomique 18S, et par analyse ultérieure des séquences. Les amorces de la PCR s'hybrident dans une région conservée spécifique des champignons, alors que la zone amplifiée a une valeur taxonomique. Les réactifs nécessaires pour réaliser la PCR et le séquençage se présentent dans un mélange de réaction gélifié avec du tréhalose, du mélézitose, du glucogène ou du raffinose, et de la lysine ou de la bétaine.
format Patent
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The PCR primers hybridize in a conserved region specific for fungi, whilst the amplified zone has taxonomic value. The reagents required for performing the PCR and also the sequencing are presented as a gelled reaction mixture with trehalose, melezitose, glycogen or rafinose, and lysine or betaine. La presente invención, describe un método para detectar la presencia y tipo de hongos y/o levaduras que se encuentran en una muestra, mediante las técnicas de amplificación y secuenciación de la región del ARN ribosómico 18S, y posterior análisis de las secuencias. Los cebadores de la PCR hibridan en una región conservada específica de hongos, mientras que la zona amplificada tiene valor taxonómico. Los reactivos necesarios para realizar tanto la PCR como la secuenciación, se presentan en una mezcla de reacción gelificada con trehalosa, melezitosa, glucógeno o rafinosa, y lisina o betaína. La présente invention concerne un procédé pour détecter la présence et un type de champignons et/ou levures qui se trouvent dans un échantillon, par des techniques d'amplification et de séquençage de la région de l'ARN ribosomique 18S, et par analyse ultérieure des séquences. Les amorces de la PCR s'hybrident dans une région conservée spécifique des champignons, alors que la zone amplifiée a une valeur taxonomique. 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The PCR primers hybridize in a conserved region specific for fungi, whilst the amplified zone has taxonomic value. The reagents required for performing the PCR and also the sequencing are presented as a gelled reaction mixture with trehalose, melezitose, glycogen or rafinose, and lysine or betaine. La presente invención, describe un método para detectar la presencia y tipo de hongos y/o levaduras que se encuentran en una muestra, mediante las técnicas de amplificación y secuenciación de la región del ARN ribosómico 18S, y posterior análisis de las secuencias. Los cebadores de la PCR hibridan en una región conservada específica de hongos, mientras que la zona amplificada tiene valor taxonómico. Los reactivos necesarios para realizar tanto la PCR como la secuenciación, se presentan en una mezcla de reacción gelificada con trehalosa, melezitosa, glucógeno o rafinosa, y lisina o betaína. 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