AUTOMATED QUANTITATIVE MULTIDIMENSIONAL VOLUMETRIC ANALYSIS AND VISUALIZATION

Methods and systems for characterizing a cell in vitro and calibrating selection criteria in samples are provided. The methods and systems utilize brightfield microscopy with a thermally-regulated, spectrally-stable light source. The method includes la beling at least one biomarker on the cell with a chromogenic label, illuminating the cell with a spectrally-stable light source configured to evenly illuminate the cell, detecting a plurality of optical planes of the cell with a brightfield microscope, acq uiring a z-stack image of the optical planes, reconstructing the optical planes in three dimensions to form an image of the cell, determining a plurality of voxels in the image of the cell, and calculating a volumetric profile for each voxel. The volumetric profile indicates one or more conditions of the biomarker and/or the cell. L'invention porte sur des procédés et des systèmes pour caractériser une cellule in vitro et calibrer des critères de sélection dans des échantillons. Les procédés et les systèmes utilisent la microscopie à fond clair avec une source de lumière thermiquement régulée, spectralement stable. Le procédé consiste à marquer au moins un biomarqueur sur la cellule à l'aide d'un marqueur chromogène, éclairer la cellule par une source de lumière spectralement stable configurée pour éclairer uniformément la cellule, détecter une pluralité de plans optiques de la cellule à l'aide d'un microscope à fond clair, acquérir une image d'empilement z des plans optiques, reconstruire les plans optiques en trois dimensions pour former une image de la cellule, déterminer une pluralité de voxels dans l'image de la cellule, et calculer un profil volumétrique pour chaque voxel. Le profil volumétrique indique une ou plusieurs conditions du biomarqueur et/ou de la cellule.