GENES DIFFERENTIALLY EXPRESSED BY CUMULUS CELLS AND ASSAYS USING SAME TO IDENTIFY PREGNANCY COMPETENT OOCYTES

A genetic means of identifying "pregnancy competent" oocytes is provided. The means comprises detecting the level of expression of one or more genes that are expressed at characteristic levels (upregulated or downregulated) in cumulus cells derived from pregnancy competent oocytes. This ch...

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Hauptverfasser: CIBELLI, JOSE, B, IAGER, AMY, E, OTU, HASAN, H
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator CIBELLI, JOSE, B
IAGER, AMY, E
OTU, HASAN, H
description A genetic means of identifying "pregnancy competent" oocytes is provided. The means comprises detecting the level of expression of one or more genes that are expressed at characteristic levels (upregulated or downregulated) in cumulus cells derived from pregnancy competent oocytes. This characteristic gene expression level, or pattern referred to herein as the "pregnancy signature", also can be used to identify subjects with underlying conditions that impair or prevent the development of a viable pregnancy, e.g., pre-menopausal condition, other hormonal dysfunction, ovarian dysfunction, ovarian cyst, cancer or other cell proliferation disorder, autoimmune disease and the like. In preferred embodiments the pregnancy signature will comprise one or more of ABCA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, and TERF2IP. L'invention porte sur un moyen génétique d'identification d'oocytes « compétents pour une grossesse ». Le moyen comprend la détection du niveau d'expression d'un ou plusieurs gènes qui sont exprimés à des niveaux caractéristiques (régulés de façon positive ou régulés de façon négative) dans des cellules du Cumulus dérivées d'oocytes compétents pour une grossesse. Ce niveau d'expression génique caractéristique, ou motif désigné ici comme étant la « signature de grossesse » peut également être utilisé pour identifier des sujets présentant des états sous-jacents qui affectent ou empêchent le développement d'une grossesse viable, par exemple un état pré-ménopausal, un autre dysfonctionnement hormonal, un dysfonctionnement ovarien, un kyste ovarien, le cancer ou un autre trouble de la prolifération cellulaire, une maladie auto-immune ou similaire. Dans des modes de réalisation préférés, la signature de grossesse comprendra un ou plusieurs parmi ABCA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, et TERF2IP.
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The means comprises detecting the level of expression of one or more genes that are expressed at characteristic levels (upregulated or downregulated) in cumulus cells derived from pregnancy competent oocytes. This characteristic gene expression level, or pattern referred to herein as the "pregnancy signature", also can be used to identify subjects with underlying conditions that impair or prevent the development of a viable pregnancy, e.g., pre-menopausal condition, other hormonal dysfunction, ovarian dysfunction, ovarian cyst, cancer or other cell proliferation disorder, autoimmune disease and the like. In preferred embodiments the pregnancy signature will comprise one or more of ABCA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, and TERF2IP. L'invention porte sur un moyen génétique d'identification d'oocytes « compétents pour une grossesse ». Le moyen comprend la détection du niveau d'expression d'un ou plusieurs gènes qui sont exprimés à des niveaux caractéristiques (régulés de façon positive ou régulés de façon négative) dans des cellules du Cumulus dérivées d'oocytes compétents pour une grossesse. Ce niveau d'expression génique caractéristique, ou motif désigné ici comme étant la « signature de grossesse » peut également être utilisé pour identifier des sujets présentant des états sous-jacents qui affectent ou empêchent le développement d'une grossesse viable, par exemple un état pré-ménopausal, un autre dysfonctionnement hormonal, un dysfonctionnement ovarien, un kyste ovarien, le cancer ou un autre trouble de la prolifération cellulaire, une maladie auto-immune ou similaire. 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Le moyen comprend la détection du niveau d'expression d'un ou plusieurs gènes qui sont exprimés à des niveaux caractéristiques (régulés de façon positive ou régulés de façon négative) dans des cellules du Cumulus dérivées d'oocytes compétents pour une grossesse. Ce niveau d'expression génique caractéristique, ou motif désigné ici comme étant la « signature de grossesse » peut également être utilisé pour identifier des sujets présentant des états sous-jacents qui affectent ou empêchent le développement d'une grossesse viable, par exemple un état pré-ménopausal, un autre dysfonctionnement hormonal, un dysfonctionnement ovarien, un kyste ovarien, le cancer ou un autre trouble de la prolifération cellulaire, une maladie auto-immune ou similaire. Dans des modes de réalisation préférés, la signature de grossesse comprendra un ou plusieurs parmi ABCA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, et TERF2IP.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>COMPOSITIONS THEREOF</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>CULTURE MEDIA</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES</subject><subject>MEASURING</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MICROORGANISMS OR ENZYMES</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PHYSICS</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>TESTING</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2011</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNqNy8sKwjAQheFuXIj6DgOuhdSCuB2TSQ2kSXESNKtSJK68FOr7YwUfwNWBn_PNi0dNjhiU0ZpO5IJBaxPQpT0RMyk4JJCxiTYySLKWAZ0CZMbEENm4GhgbguDBqC_XCSZaO3Rykr5pKUwZvJcpEC-L2a2_j3n120Wx1hTkcZOHV5fHob_mZ353Z78VZSl2QuwFVtV_rw83Dzgt</recordid><startdate>20111117</startdate><enddate>20111117</enddate><creator>CIBELLI, JOSE, B</creator><creator>IAGER, AMY, E</creator><creator>OTU, HASAN, H</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20111117</creationdate><title>GENES DIFFERENTIALLY EXPRESSED BY CUMULUS CELLS AND ASSAYS USING SAME TO IDENTIFY PREGNANCY COMPETENT OOCYTES</title><author>CIBELLI, JOSE, B ; IAGER, AMY, E ; OTU, HASAN, H</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO2011060080A33</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2011</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>COMPOSITIONS THEREOF</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>CULTURE MEDIA</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIRCHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES</topic><topic>MEASURING</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MICROORGANISMS OR ENZYMES</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PHYSICS</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>TESTING</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>CIBELLI, JOSE, B</creatorcontrib><creatorcontrib>IAGER, AMY, E</creatorcontrib><creatorcontrib>OTU, HASAN, H</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>CIBELLI, JOSE, B</au><au>IAGER, AMY, E</au><au>OTU, HASAN, H</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>GENES DIFFERENTIALLY EXPRESSED BY CUMULUS CELLS AND ASSAYS USING SAME TO IDENTIFY PREGNANCY COMPETENT OOCYTES</title><date>2011-11-17</date><risdate>2011</risdate><abstract>A genetic means of identifying "pregnancy competent" oocytes is provided. The means comprises detecting the level of expression of one or more genes that are expressed at characteristic levels (upregulated or downregulated) in cumulus cells derived from pregnancy competent oocytes. This characteristic gene expression level, or pattern referred to herein as the "pregnancy signature", also can be used to identify subjects with underlying conditions that impair or prevent the development of a viable pregnancy, e.g., pre-menopausal condition, other hormonal dysfunction, ovarian dysfunction, ovarian cyst, cancer or other cell proliferation disorder, autoimmune disease and the like. In preferred embodiments the pregnancy signature will comprise one or more of ABCA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, and TERF2IP. L'invention porte sur un moyen génétique d'identification d'oocytes « compétents pour une grossesse ». Le moyen comprend la détection du niveau d'expression d'un ou plusieurs gènes qui sont exprimés à des niveaux caractéristiques (régulés de façon positive ou régulés de façon négative) dans des cellules du Cumulus dérivées d'oocytes compétents pour une grossesse. Ce niveau d'expression génique caractéristique, ou motif désigné ici comme étant la « signature de grossesse » peut également être utilisé pour identifier des sujets présentant des états sous-jacents qui affectent ou empêchent le développement d'une grossesse viable, par exemple un état pré-ménopausal, un autre dysfonctionnement hormonal, un dysfonctionnement ovarien, un kyste ovarien, le cancer ou un autre trouble de la prolifération cellulaire, une maladie auto-immune ou similaire. Dans des modes de réalisation préférés, la signature de grossesse comprendra un ou plusieurs parmi ABCA6, NCAM1, OLFML3, PTPRA, SDF4, GPR137B, DDIT4, DUSP1, GPR137B, IDUA, KCTD5, NDNL2, SLC26A3, et TERF2IP.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
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