METHODS FOR AMPLIFYING HEPATITIS C VIRUS NUCLEIC ACIDS
A method of amplifying an HCV nucleic acid in an HCV infected sample comprises amplifying a segment of a DNA template that is complementary to a genome of HCV RNA from the sample by a two-stage PCR, wherein a first stage PCR employs a first outer primer and a second outer primer, and a second stage...
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| creator | FRANTZ, JAMES, DANIEL SHAMES, BENJAMIN SULLIVAN, JAMES, C LIPPKE, JUDITH, A ZHANG, EILEEN, Z BARTELS, DOUGLAS, J SEEPERSAUD, SHEILA ZHOU, YI LIN, CHAO KWONG, ANN, D KIEFFER, TARA, L |
| description | A method of amplifying an HCV nucleic acid in an HCV infected sample comprises amplifying a segment of a DNA template that is complementary to a genome of HCV RNA from the sample by a two-stage PCR, wherein a first stage PCR employs a first outer primer and a second outer primer, and a second stage PCR employs a first inner primer and a second inner primer. The nucleotide sequence of the first outer primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 2; or SEQ ID NO:9, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 9. The nucleotide sequence of the second outer primer comprises a nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3 or 4; or a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 10 or 11, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 10 and 11. The nucleotide sequence of the first inner primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 5; or SEQ ID NO: 12, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 12. The nucleotide sequence of the second inner primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 6 or 7; or a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 13 or 14, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 13 and 14.
L'invention concerne un procédé d'amplification d'acide nucléique de VHC dans un échantillon infecté par le VHC comprenant l'amplification d'un segment d'une matrice d'ADN qui est complémentaire d'un génome d'ARN de VHC de l'échantillon par une PCR en deux étapes, une PCR de première étape employant une première amorce externe et une deuxième amorce externe et une PCR de deuxième étape employant une première amorce interne et une deuxième amorce interne. La séquence nucléotidique de la première amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 2; ou SEQ ID NO:9, dans laquelle, en option, 1, 2 ou 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 9. La séquence nucléotidique de la deuxième amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 3 ou 4; ou une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 10 ou 11, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 10 et 11. La séquence nucléotidique de la première amorce interne comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 5; ou SEQ ID NO: 12, dans l |
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L'invention concerne un procédé d'amplification d'acide nucléique de VHC dans un échantillon infecté par le VHC comprenant l'amplification d'un segment d'une matrice d'ADN qui est complémentaire d'un génome d'ARN de VHC de l'échantillon par une PCR en deux étapes, une PCR de première étape employant une première amorce externe et une deuxième amorce externe et une PCR de deuxième étape employant une première amorce interne et une deuxième amorce interne. La séquence nucléotidique de la première amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 2; ou SEQ ID NO:9, dans laquelle, en option, 1, 2 ou 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 9. La séquence nucléotidique de la deuxième amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 3 ou 4; ou une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 10 ou 11, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 10 et 11. La séquence nucléotidique de la première amorce interne comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 5; ou SEQ ID NO: 12, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 12. La séquence nucléotidique de la deuxième amorce interne comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 6 ou 7; ou une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 13 ou 14, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 13 et 14.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2010</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20101125&DB=EPODOC&CC=WO&NR=2010090857A3$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76419</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20101125&DB=EPODOC&CC=WO&NR=2010090857A3$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>FRANTZ, JAMES, DANIEL</creatorcontrib><creatorcontrib>SHAMES, BENJAMIN</creatorcontrib><creatorcontrib>SULLIVAN, JAMES, C</creatorcontrib><creatorcontrib>LIPPKE, JUDITH, A</creatorcontrib><creatorcontrib>ZHANG, EILEEN, Z</creatorcontrib><creatorcontrib>BARTELS, DOUGLAS, J</creatorcontrib><creatorcontrib>SEEPERSAUD, SHEILA</creatorcontrib><creatorcontrib>ZHOU, YI</creatorcontrib><creatorcontrib>LIN, CHAO</creatorcontrib><creatorcontrib>KWONG, ANN, D</creatorcontrib><creatorcontrib>KIEFFER, TARA, L</creatorcontrib><title>METHODS FOR AMPLIFYING HEPATITIS C VIRUS NUCLEIC ACIDS</title><description>A method of amplifying an HCV nucleic acid in an HCV infected sample comprises amplifying a segment of a DNA template that is complementary to a genome of HCV RNA from the sample by a two-stage PCR, wherein a first stage PCR employs a first outer primer and a second outer primer, and a second stage PCR employs a first inner primer and a second inner primer. The nucleotide sequence of the first outer primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 2; or SEQ ID NO:9, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 9. The nucleotide sequence of the second outer primer comprises a nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3 or 4; or a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 10 or 11, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 10 and 11. The nucleotide sequence of the first inner primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 5; or SEQ ID NO: 12, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 12. The nucleotide sequence of the second inner primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 6 or 7; or a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 13 or 14, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 13 and 14.
L'invention concerne un procédé d'amplification d'acide nucléique de VHC dans un échantillon infecté par le VHC comprenant l'amplification d'un segment d'une matrice d'ADN qui est complémentaire d'un génome d'ARN de VHC de l'échantillon par une PCR en deux étapes, une PCR de première étape employant une première amorce externe et une deuxième amorce externe et une PCR de deuxième étape employant une première amorce interne et une deuxième amorce interne. La séquence nucléotidique de la première amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 2; ou SEQ ID NO:9, dans laquelle, en option, 1, 2 ou 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 9. La séquence nucléotidique de la deuxième amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 3 ou 4; ou une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 10 ou 11, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 10 et 11. La séquence nucléotidique de la première amorce interne comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 5; ou SEQ ID NO: 12, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 12. 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The nucleotide sequence of the first outer primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 2; or SEQ ID NO:9, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 9. The nucleotide sequence of the second outer primer comprises a nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 3 or 4; or a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 10 or 11, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 10 and 11. The nucleotide sequence of the first inner primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 5; or SEQ ID NO: 12, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 12. The nucleotide sequence of the second inner primer comprises a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 6 or 7; or a nucleotide sequence as set forth in SEQ ID NO: 13 or 14, wherein optionally 1, 2 or 3 nucleotides are other nucleotides than those of SEQ ID NO: 13 and 14.
L'invention concerne un procédé d'amplification d'acide nucléique de VHC dans un échantillon infecté par le VHC comprenant l'amplification d'un segment d'une matrice d'ADN qui est complémentaire d'un génome d'ARN de VHC de l'échantillon par une PCR en deux étapes, une PCR de première étape employant une première amorce externe et une deuxième amorce externe et une PCR de deuxième étape employant une première amorce interne et une deuxième amorce interne. La séquence nucléotidique de la première amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 2; ou SEQ ID NO:9, dans laquelle, en option, 1, 2 ou 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 9. La séquence nucléotidique de la deuxième amorce externe comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 3 ou 4; ou une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 10 ou 11, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 10 et 11. La séquence nucléotidique de la première amorce interne comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 5; ou SEQ ID NO: 12, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 12. La séquence nucléotidique de la deuxième amorce interne comprend une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 6 ou 7; ou une séquence nucléotidique présentée dans SEQ ID NO: 13 ou 14, dans laquelle, en option, 1, 2 or 3 nucléotides sont des nucléotides autres que ceux de SEQ ID NO: 13 et 14.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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