METHODS AND COMPOSITIONS FOR KIR GENOTYPING

The present invention provides methods for single nucleotide polymorphism (SNP)-based killer cell immunoglobulin-like receptor (KIR) gene cluster genotyping using the matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight (MALDI-TOF) mass spectrometer. In general, the methods involve amplifying a plurality of target sequences of a plurality of KIR genes, and detecting the presence or absence of a plurality of single SNPs of the plurality of KIR genes by MALDI-TOF mass spectrometery. The invention also features compositions, including arrays of capture primers and optionally extension primers on a substrate surface, and kits, for use in the methods of the invention. La présente invention concerne des procédés de génotypage d'une famille de gènes du récepteur de type immunoglobuline de cellules tueuses (KIR) reposant sur un polymorphisme d'un nucléotide simple (SNP), ce génotypage étant effectué au moyen d'un spectromètre de masse à temps de vol par désorption-ionisation par impact laser assistée par matrice (MALDI-TOF). En général, les procédés impliquent d'amplifier une pluralité de séquences cibles d'une pluralité de gènes KIR et de détecter, par spectrométrie de masse MALDI-TOF, la présence ou l'absence d'une pluralité de SNP unique des multiples gènes KIR. Cette invention concerne également des compositions comprenant des réseaux d'amorces de capture et éventuellement d'amorces d'extension situés sur une surface de substrat ainsi que des trousses destinées à être utilisées dans les procédés selon l'invention.