METHOD OF INHIBITING EXPRESSION OF TARGET MRNA USING SIRNA CONSISTING OF NUCLEOTIDE SEQUENCE COMPLEMENTARY TO SAID TARGET MRNA
A inhibition method of target mRNA expression includes: (a) obtaining binding energy of a double combination section on a dsRNA sequence of all combination comprising complementary nucleotides to a random target mRNA; (b) dividing the binding energy into four sections on the dsRNA sequence of each c...
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Format: | Patent |
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Zusammenfassung: | A inhibition method of target mRNA expression includes: (a) obtaining binding energy of a double combination section on a dsRNA sequence of all combination comprising complementary nucleotides to a random target mRNA; (b) dividing the binding energy into four sections on the dsRNA sequence of each combination to obtain a difference of the mean binding energy between each section and convert into a score of a relative combination energy pattern; (c) selecting siRNA whose inhibition efficiency to target mRNA is expected to be high by applying the converted score to the dsRNA sequence with other factors that affect the efficiency of siRNA; and (d) inhibiting target mRNA expression using the selected siRNA. As a result, a researcher or an experimenter can analyze patterns of a relative binding energy on base sequences of unknown siRNA without actual experiments to determine whether the siRNA is effective or ineffective rapidly, thereby design and production efficiency of siRNA can be maximized and target mRNA can be effectively inhibited with efficient siRNA to the target mRNA.
L'invention concerne une méthode d'inhibition de l'expression d'un ARNm cible. Cette méthode consiste: (a) à obtenir une énergie de liaison d'une partie de combinaison double sur une séquence d'ARN bicaténaire de toutes les combinaisons comprenant des nucléotides complémentaires d'un ARNm cible aléatoire; (b) à diviser l'énergie de liaison en quatre parties sur la séquence d'ARN bicaténaire de chaque combinaison, afin d'obtenir une différence de l'énergie de liaison moyenne entre chaque partie et la convertir en une note de modèle d'énergie de combinaison relative; (c) à sélectionner un petit ARN interférent dont l'efficacité d'inhibition d'ARNm cible est supposée élevée, par application de la note convertie sur la séquence d'ARN bicaténaire avec d'autres facteurs qui affectent l'efficacité du petit ARN interférent; et (d) à inhiber l'expression de l'ARNm cible au moyen du petit ARN interférent choisi. Un chercheur ou un expérimentateur peut ainsi analyser des modèles d'énergie de liaison relative sur des séquences de base d'un petit ARN interférent inconnu, sans avoir recours à des expériences réelles, afin de déterminer rapidement si le petit ARN interférent est efficace ou inefficace, ce qui permet de maximiser l'efficacité de conception et de production d'un petit ARN interférent, et d'inhiber efficacement un ARNm cible au moyen d'un petit ARN interférent efficace. |
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