SINGLE MOLECULE SEQUENCING USING PHOSPHATE LABELED NUCLEOTIDES
The present invention relates to a process for sequencing nucleic acids wherein the nucleic acid molecule to be sequenced is sequentially degraded in the presence of a fluorescence labeled reagent wherein a fluorescence labeled nucleoside is formed having nucleobase-specific fluorescence characteris...
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Format: | Patent |
Sprache: | eng ; fre |
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creator | GAIKO, NATALIA, N FRITZ, HANS-JOACHIM GRIESINGER, CHRISTIAN FRIES, JOACHIM BERGER, SYLVIA SEIDEL, CLAUS |
description | The present invention relates to a process for sequencing nucleic acids wherein the nucleic acid molecule to be sequenced is sequentially degraded in the presence of a fluorescence labeled reagent wherein a fluorescence labeled nucleoside is formed having nucleobase-specific fluorescence characteristics. Preferably the method is a single molecule sequencing procedure comprising a spatially resolved detection step, e.g. confocal detection. Preferably the method comprises a confocal detection step. Further, novel nucleobase-specific fluorescence dyes and reagents containing said dyes are provided.
L'invention concerne un procédé de séquençage d'acides nucléiques selon lequel la molécule d'acide nucléique à séquencer est dégradée de manière séquentielle en présence d'un réactif marqué par fluorescence, un nucléoside marqué par fluorescence étant formé et présentant des caractéristiques de fluorescence spécifiques d'une nucléobase. De préférence, ce procédé est mis en oeuvre par une procédure de séquençage de molécule unique qui comprend une étape de détection résolue de manière spatiale, par exemple de détection confocale. De préférence, ce procédé comprend une étape de détection confocale. L'invention concerne en outre des nouveaux colorants fluorescents spécifiques d'une nucléobase et des réactifs contenant ces colorants. |
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L'invention concerne un procédé de séquençage d'acides nucléiques selon lequel la molécule d'acide nucléique à séquencer est dégradée de manière séquentielle en présence d'un réactif marqué par fluorescence, un nucléoside marqué par fluorescence étant formé et présentant des caractéristiques de fluorescence spécifiques d'une nucléobase. De préférence, ce procédé est mis en oeuvre par une procédure de séquençage de molécule unique qui comprend une étape de détection résolue de manière spatiale, par exemple de détection confocale. De préférence, ce procédé comprend une étape de détection confocale. L'invention concerne en outre des nouveaux colorants fluorescents spécifiques d'une nucléobase et des réactifs contenant ces colorants.</description><edition>7</edition><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2003</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20031002&DB=EPODOC&CC=WO&NR=03080861A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,776,881,25543,76294</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20031002&DB=EPODOC&CC=WO&NR=03080861A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>GAIKO, NATALIA, N</creatorcontrib><creatorcontrib>FRITZ, HANS-JOACHIM</creatorcontrib><creatorcontrib>GRIESINGER, CHRISTIAN</creatorcontrib><creatorcontrib>FRIES, JOACHIM</creatorcontrib><creatorcontrib>BERGER, SYLVIA</creatorcontrib><creatorcontrib>SEIDEL, CLAUS</creatorcontrib><title>SINGLE MOLECULE SEQUENCING USING PHOSPHATE LABELED NUCLEOTIDES</title><description>The present invention relates to a process for sequencing nucleic acids wherein the nucleic acid molecule to be sequenced is sequentially degraded in the presence of a fluorescence labeled reagent wherein a fluorescence labeled nucleoside is formed having nucleobase-specific fluorescence characteristics. Preferably the method is a single molecule sequencing procedure comprising a spatially resolved detection step, e.g. confocal detection. Preferably the method comprises a confocal detection step. Further, novel nucleobase-specific fluorescence dyes and reagents containing said dyes are provided.
L'invention concerne un procédé de séquençage d'acides nucléiques selon lequel la molécule d'acide nucléique à séquencer est dégradée de manière séquentielle en présence d'un réactif marqué par fluorescence, un nucléoside marqué par fluorescence étant formé et présentant des caractéristiques de fluorescence spécifiques d'une nucléobase. De préférence, ce procédé est mis en oeuvre par une procédure de séquençage de molécule unique qui comprend une étape de détection résolue de manière spatiale, par exemple de détection confocale. De préférence, ce procédé comprend une étape de détection confocale. L'invention concerne en outre des nouveaux colorants fluorescents spécifiques d'une nucléobase et des réactifs contenant ces colorants.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2003</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZLAL9vRz93FV8PX3cXUOBTKCXQNDXf2cgaIKoSA5hQAP_-AAD8cQVwUfRydXH1cXBb9QZx9X_xBPF9dgHgbWtMSc4lReKM3NoOjmGuLsoZtakB-fWlyQmJyal1oSH-5vYGxgYWBhZuhoaEyMGgBzAipp</recordid><startdate>20031002</startdate><enddate>20031002</enddate><creator>GAIKO, NATALIA, N</creator><creator>FRITZ, HANS-JOACHIM</creator><creator>GRIESINGER, CHRISTIAN</creator><creator>FRIES, JOACHIM</creator><creator>BERGER, SYLVIA</creator><creator>SEIDEL, CLAUS</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20031002</creationdate><title>SINGLE MOLECULE SEQUENCING USING PHOSPHATE LABELED NUCLEOTIDES</title><author>GAIKO, NATALIA, N ; FRITZ, HANS-JOACHIM ; GRIESINGER, CHRISTIAN ; FRIES, JOACHIM ; BERGER, SYLVIA ; SEIDEL, CLAUS</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_WO03080861A13</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2003</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>GAIKO, NATALIA, N</creatorcontrib><creatorcontrib>FRITZ, HANS-JOACHIM</creatorcontrib><creatorcontrib>GRIESINGER, CHRISTIAN</creatorcontrib><creatorcontrib>FRIES, JOACHIM</creatorcontrib><creatorcontrib>BERGER, SYLVIA</creatorcontrib><creatorcontrib>SEIDEL, CLAUS</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>GAIKO, NATALIA, N</au><au>FRITZ, HANS-JOACHIM</au><au>GRIESINGER, CHRISTIAN</au><au>FRIES, JOACHIM</au><au>BERGER, SYLVIA</au><au>SEIDEL, CLAUS</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>SINGLE MOLECULE SEQUENCING USING PHOSPHATE LABELED NUCLEOTIDES</title><date>2003-10-02</date><risdate>2003</risdate><abstract>The present invention relates to a process for sequencing nucleic acids wherein the nucleic acid molecule to be sequenced is sequentially degraded in the presence of a fluorescence labeled reagent wherein a fluorescence labeled nucleoside is formed having nucleobase-specific fluorescence characteristics. Preferably the method is a single molecule sequencing procedure comprising a spatially resolved detection step, e.g. confocal detection. Preferably the method comprises a confocal detection step. Further, novel nucleobase-specific fluorescence dyes and reagents containing said dyes are provided.
L'invention concerne un procédé de séquençage d'acides nucléiques selon lequel la molécule d'acide nucléique à séquencer est dégradée de manière séquentielle en présence d'un réactif marqué par fluorescence, un nucléoside marqué par fluorescence étant formé et présentant des caractéristiques de fluorescence spécifiques d'une nucléobase. De préférence, ce procédé est mis en oeuvre par une procédure de séquençage de molécule unique qui comprend une étape de détection résolue de manière spatiale, par exemple de détection confocale. De préférence, ce procédé comprend une étape de détection confocale. L'invention concerne en outre des nouveaux colorants fluorescents spécifiques d'une nucléobase et des réactifs contenant ces colorants.</abstract><edition>7</edition><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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