PCR-BASED MONITORING IN WASTEWATER BIOTREATMENT SYSTEMS

PCR-based monitoring of microorganisms in systems for the biological treatment of wastewater. In particular, measuring both the abundance and expression of indicator/effector genes or gene combinations, where expression of an "effector" gene correlates with the degradative activity of a particular microbial sample, and where the abundance of an "indicator" gene correlates with the abundance of microbe. Effector gene expression is measured by competitive quantitative RT-PCR, and indicator gene abundance is measured by competitive quantitative PCR. The indicator and effector genes may be the same or different genes. In one embodiment, the indicator and effector gene are sequences from the glyphosate oxidoreductase (gox) gene and the quantitative techniques employed are competitive quantitative PCR and competitive quantitative RT-PCR. La présente invention se rapporte au contrôle, fondé sur une réaction PCR, de micro-organismes dans des systèmes de traitement biologique des eaux usées. Elle concerne en particulier la mesure à la fois de l'abondance et de l'expression de gènes indicateurs/effecteurs ou de combinaisons géniques, l'expression d'un gène "effecteur" étant corrélée à l'activité de dégradation d'un échantillon microbien particulier et l'abondance d'un gène "indicateur" étant corrélée à l'abondance du microbe. L'expression d'un gène effecteur est mesurée par une réaction RT-PCR quantitative et compétitive, et l'abondance d'un gène indicateur est mesurée par une réaction PCR quantitative et compétitive. Les gènes indicateurs et effecteurs peuvent être identiques ou différents. Dans un mode de réalisation, les gènes indicateurs et effecteurs sont des séquences issues du gène de la glyphosate oxydoréductase ( gox ) et les techniques quantitatives mises en oeuvre sont une réaction PCR compétitive quantitative et une réaction RT-PCR compétitive quantitative.