METHOD OF MASS-SPECTROMETRIC SEQUENCING OF PEPTIDES WITH THE PREFERENTIAL B-ION FORMATION

FIELD: chemistry.SUBSTANCE: invention relates to bioorganic chemistry and can be used to determine the amino acid sequence of peptides and their fragments by mass spectrometry method. For this, sequencing of the dansylated peptide based on the direct introduction of the solution into the ion source followed by fragmentation of the molecular peptide ion in the area between the nozzle and the skimmer of the ion source by the action of an electric field at several discrete values of the electric field strength in the range 10-10V/m and residual gas pressure in the range of 100-2,000 Pa. Presence of a dansyl residue on the N-terminal amino group of the peptide allows to avoid the cyclization of short fragments of the peptide and leads to the preferential formation of b-ions, which are registered predominantly in the form of protonated dehydrated fragments, including the smallest molecular weight ions band b, which allows to determine the full amino acid sequence of the parent peptide. Average values of the fragmentation parameters: voltage on the capillary 3,400 V, on the nozzle 90-140 V, on the skimmer 60-90 V, the values of these parameters vary depending on the nature and number of amino acids that form the peptide, the system records and determines the amino acid sequence of the peptides.EFFECT: invention provides a simplification of the interpretation of mass spectra and increases the reliability of determining the complete amino acid sequence of the peptides to be studied.1 cl, 5 dwg, 1 ex Изобретение относится к биоорганической химии и может быть использовано для определения аминокислотной последовательности пептидов и их фрагментов методом масс-спектрометрии. Для этого проводят секвенирование дансилированного пептида, основанное на прямом вводе раствора в источник ионов с последующей фрагментацией молекулярного иона пептида в области между соплом и скиммером источника ионов воздействием электрического поля при нескольких дискретных значениях напряженности электрического поля в диапазоне 10-10В/м и давлении остаточного газа в диапазоне 100-2000 Па. Наличие дансильного остатка на N-концевой аминогруппе пептида позволяет избежать циклизации коротких фрагментов пептида и приводит к преимущественному образованию b-ионов, которые регистрируются преимущественно в форме протонированных дегидратированных фрагментов, включая наименьшие по молекулярной массе ионы bи b, что позволяет установить полную аминокислотную последовательность исходного пептида. Усредненны