METHOD FOR DNA SEQUENCING

The claimed invention relates to the field of genetic engineering and biotechnology. Technical result achieved in application of the claimed invention, consists in provision of possibility to decode nucleotide sequence of DNA by analysis of mechanical fluctuations, generated in the process of DNA po...

Ausführliche Beschreibung

Gespeichert in:
Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: VOLKOV YURIY, PETROVICH, MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH, YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH
Format: Patent
Sprache:eng ; rus
Schlagworte:
Online-Zugang:Volltext bestellen
Tags: Tag hinzufügen
Keine Tags, Fügen Sie den ersten Tag hinzu!
container_end_page
container_issue
container_start_page
container_title
container_volume
creator VOLKOV YURIY, PETROVICH
MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH
YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH
description The claimed invention relates to the field of genetic engineering and biotechnology. Technical result achieved in application of the claimed invention, consists in provision of possibility to decode nucleotide sequence of DNA by analysis of mechanical fluctuations, generated in the process of DNA polymerase transfer in the course of polymerase chain reaction (PCR). In accordance with the claimed method, in the course of PCR separate copies of DNA fragment are placed in four solutions, each of which is characterised by considerably reduced concentration of one of nucleotides compared to the remaining three nucleotides, while carrying out polymerase chain reaction in each of solutions registered is abrupt transfer of DNA polymerase on DNA chain in the process of synthesis, taking place after binding next nucleotide with measurement of time intervals between DNA polymerase transfers, presence of considerably larger time interval leads to conclusion about binding of nucleotide with reduced concentration with determination of said nucleotide location in sequences DNA, sequence of nucleotides in sequenced DNA is retrieved by combination of obtained data about location of nucleotides in each of four solutions. Заявляемое изобретение относится к области генной инженерии и биотехнологии. Технический результат, достигаемый при использовании заявляемого изобретения, заключается в обеспечении возможности расшифровки нуклеотидной последовательности ДНК посредством анализа механических колебаний, возникающих при перемещении ДНК полимеразы в ходе проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР). Согласно заявляемому решению при проведении ПЦР отдельные копии фрагмента ДНК помещают в четыре раствора, каждый из которых характеризуется значительно сниженной концентрацией одного из нуклеотидов, по сравнению с остальными тремя нуклеотидами, во время проведения полимеразной цепной реакции в каждом из растворов регистрируют скачкообразное перемещение ДНК полимеразы по цепочке ДНК в процессе синтеза, возникающее после присоединения очередного нуклеотида с измерением промежутков времени между перемещениями ДНК полимеразы, по наличию значительного большего промежутка времени делают вывод о присоединении нуклеотида с пониженной концентрацией и определяют расположение данного нуклеотида в секвенируемой ДНК, последовательность нуклеотидов в секвенированной ДНК восстанавливают путем совмещения полученных данных о расположении нуклеотидов в каждом из четырех растворов.
format Patent
fullrecord <record><control><sourceid>epo_EVB</sourceid><recordid>TN_cdi_epo_espacenet_EA022475B1</recordid><sourceformat>XML</sourceformat><sourcesystem>PC</sourcesystem><sourcerecordid>EA022475B1</sourcerecordid><originalsourceid>FETCH-epo_espacenet_EA022475B13</originalsourceid><addsrcrecordid>eNrjZJD0dQ3x8HdRcPMPUnDxc1QIdg0MdfVz9vRz52FgTUvMKU7lhdLcDPJuriHOHrqpBfnxqcUFicmpeakl8a6OBkZGJuamTobGhFUAAIXPHt8</addsrcrecordid><sourcetype>Open Access Repository</sourcetype><iscdi>true</iscdi><recordtype>patent</recordtype></control><display><type>patent</type><title>METHOD FOR DNA SEQUENCING</title><source>esp@cenet</source><creator>VOLKOV YURIY, PETROVICH ; MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH ; YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</creator><creatorcontrib>VOLKOV YURIY, PETROVICH ; MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH ; YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</creatorcontrib><description>The claimed invention relates to the field of genetic engineering and biotechnology. Technical result achieved in application of the claimed invention, consists in provision of possibility to decode nucleotide sequence of DNA by analysis of mechanical fluctuations, generated in the process of DNA polymerase transfer in the course of polymerase chain reaction (PCR). In accordance with the claimed method, in the course of PCR separate copies of DNA fragment are placed in four solutions, each of which is characterised by considerably reduced concentration of one of nucleotides compared to the remaining three nucleotides, while carrying out polymerase chain reaction in each of solutions registered is abrupt transfer of DNA polymerase on DNA chain in the process of synthesis, taking place after binding next nucleotide with measurement of time intervals between DNA polymerase transfers, presence of considerably larger time interval leads to conclusion about binding of nucleotide with reduced concentration with determination of said nucleotide location in sequences DNA, sequence of nucleotides in sequenced DNA is retrieved by combination of obtained data about location of nucleotides in each of four solutions. Заявляемое изобретение относится к области генной инженерии и биотехнологии. Технический результат, достигаемый при использовании заявляемого изобретения, заключается в обеспечении возможности расшифровки нуклеотидной последовательности ДНК посредством анализа механических колебаний, возникающих при перемещении ДНК полимеразы в ходе проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР). Согласно заявляемому решению при проведении ПЦР отдельные копии фрагмента ДНК помещают в четыре раствора, каждый из которых характеризуется значительно сниженной концентрацией одного из нуклеотидов, по сравнению с остальными тремя нуклеотидами, во время проведения полимеразной цепной реакции в каждом из растворов регистрируют скачкообразное перемещение ДНК полимеразы по цепочке ДНК в процессе синтеза, возникающее после присоединения очередного нуклеотида с измерением промежутков времени между перемещениями ДНК полимеразы, по наличию значительного большего промежутка времени делают вывод о присоединении нуклеотида с пониженной концентрацией и определяют расположение данного нуклеотида в секвенируемой ДНК, последовательность нуклеотидов в секвенированной ДНК восстанавливают путем совмещения полученных данных о расположении нуклеотидов в каждом из четырех растворов.</description><language>eng ; rus</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASUREMENT OF MECHANICAL VIBRATIONS OR ULTRASONIC, SONIC ORINFRASONIC WAVES ; MEASURING ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PHYSICS ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; TESTING ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2016</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160129&amp;DB=EPODOC&amp;CC=EA&amp;NR=022475B1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,778,883,25547,76298</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160129&amp;DB=EPODOC&amp;CC=EA&amp;NR=022475B1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>VOLKOV YURIY, PETROVICH</creatorcontrib><creatorcontrib>MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH</creatorcontrib><creatorcontrib>YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</creatorcontrib><title>METHOD FOR DNA SEQUENCING</title><description>The claimed invention relates to the field of genetic engineering and biotechnology. Technical result achieved in application of the claimed invention, consists in provision of possibility to decode nucleotide sequence of DNA by analysis of mechanical fluctuations, generated in the process of DNA polymerase transfer in the course of polymerase chain reaction (PCR). In accordance with the claimed method, in the course of PCR separate copies of DNA fragment are placed in four solutions, each of which is characterised by considerably reduced concentration of one of nucleotides compared to the remaining three nucleotides, while carrying out polymerase chain reaction in each of solutions registered is abrupt transfer of DNA polymerase on DNA chain in the process of synthesis, taking place after binding next nucleotide with measurement of time intervals between DNA polymerase transfers, presence of considerably larger time interval leads to conclusion about binding of nucleotide with reduced concentration with determination of said nucleotide location in sequences DNA, sequence of nucleotides in sequenced DNA is retrieved by combination of obtained data about location of nucleotides in each of four solutions. Заявляемое изобретение относится к области генной инженерии и биотехнологии. Технический результат, достигаемый при использовании заявляемого изобретения, заключается в обеспечении возможности расшифровки нуклеотидной последовательности ДНК посредством анализа механических колебаний, возникающих при перемещении ДНК полимеразы в ходе проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР). Согласно заявляемому решению при проведении ПЦР отдельные копии фрагмента ДНК помещают в четыре раствора, каждый из которых характеризуется значительно сниженной концентрацией одного из нуклеотидов, по сравнению с остальными тремя нуклеотидами, во время проведения полимеразной цепной реакции в каждом из растворов регистрируют скачкообразное перемещение ДНК полимеразы по цепочке ДНК в процессе синтеза, возникающее после присоединения очередного нуклеотида с измерением промежутков времени между перемещениями ДНК полимеразы, по наличию значительного большего промежутка времени делают вывод о присоединении нуклеотида с пониженной концентрацией и определяют расположение данного нуклеотида в секвенируемой ДНК, последовательность нуклеотидов в секвенированной ДНК восстанавливают путем совмещения полученных данных о расположении нуклеотидов в каждом из четырех растворов.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASUREMENT OF MECHANICAL VIBRATIONS OR ULTRASONIC, SONIC ORINFRASONIC WAVES</subject><subject>MEASURING</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PHYSICS</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>TESTING</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2016</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZJD0dQ3x8HdRcPMPUnDxc1QIdg0MdfVz9vRz52FgTUvMKU7lhdLcDPJuriHOHrqpBfnxqcUFicmpeakl8a6OBkZGJuamTobGhFUAAIXPHt8</recordid><startdate>20160129</startdate><enddate>20160129</enddate><creator>VOLKOV YURIY, PETROVICH</creator><creator>MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH</creator><creator>YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20160129</creationdate><title>METHOD FOR DNA SEQUENCING</title><author>VOLKOV YURIY, PETROVICH ; MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH ; YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_EA022475B13</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; rus</language><creationdate>2016</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASUREMENT OF MECHANICAL VIBRATIONS OR ULTRASONIC, SONIC ORINFRASONIC WAVES</topic><topic>MEASURING</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PHYSICS</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>TESTING</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>VOLKOV YURIY, PETROVICH</creatorcontrib><creatorcontrib>MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH</creatorcontrib><creatorcontrib>YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>VOLKOV YURIY, PETROVICH</au><au>MANTUROV ALEKSEY, OLEGOVICH</au><au>YUDAKOV MIKHAIL, ALEKSANDROVICH</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>METHOD FOR DNA SEQUENCING</title><date>2016-01-29</date><risdate>2016</risdate><abstract>The claimed invention relates to the field of genetic engineering and biotechnology. Technical result achieved in application of the claimed invention, consists in provision of possibility to decode nucleotide sequence of DNA by analysis of mechanical fluctuations, generated in the process of DNA polymerase transfer in the course of polymerase chain reaction (PCR). In accordance with the claimed method, in the course of PCR separate copies of DNA fragment are placed in four solutions, each of which is characterised by considerably reduced concentration of one of nucleotides compared to the remaining three nucleotides, while carrying out polymerase chain reaction in each of solutions registered is abrupt transfer of DNA polymerase on DNA chain in the process of synthesis, taking place after binding next nucleotide with measurement of time intervals between DNA polymerase transfers, presence of considerably larger time interval leads to conclusion about binding of nucleotide with reduced concentration with determination of said nucleotide location in sequences DNA, sequence of nucleotides in sequenced DNA is retrieved by combination of obtained data about location of nucleotides in each of four solutions. Заявляемое изобретение относится к области генной инженерии и биотехнологии. Технический результат, достигаемый при использовании заявляемого изобретения, заключается в обеспечении возможности расшифровки нуклеотидной последовательности ДНК посредством анализа механических колебаний, возникающих при перемещении ДНК полимеразы в ходе проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР). Согласно заявляемому решению при проведении ПЦР отдельные копии фрагмента ДНК помещают в четыре раствора, каждый из которых характеризуется значительно сниженной концентрацией одного из нуклеотидов, по сравнению с остальными тремя нуклеотидами, во время проведения полимеразной цепной реакции в каждом из растворов регистрируют скачкообразное перемещение ДНК полимеразы по цепочке ДНК в процессе синтеза, возникающее после присоединения очередного нуклеотида с измерением промежутков времени между перемещениями ДНК полимеразы, по наличию значительного большего промежутка времени делают вывод о присоединении нуклеотида с пониженной концентрацией и определяют расположение данного нуклеотида в секвенируемой ДНК, последовательность нуклеотидов в секвенированной ДНК восстанавливают путем совмещения полученных данных о расположении нуклеотидов в каждом из четырех растворов.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
fulltext fulltext_linktorsrc
identifier
ispartof
issn
language eng ; rus
recordid cdi_epo_espacenet_EA022475B1
source esp@cenet
subjects BEER
BIOCHEMISTRY
CHEMISTRY
COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR
CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES
ENZYMOLOGY
MEASUREMENT OF MECHANICAL VIBRATIONS OR ULTRASONIC, SONIC ORINFRASONIC WAVES
MEASURING
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS
METALLURGY
MICROBIOLOGY
MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
PHYSICS
PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS
SPIRITS
TESTING
VINEGAR
WINE
title METHOD FOR DNA SEQUENCING
url https://sfx.bib-bvb.de/sfx_tum?ctx_ver=Z39.88-2004&ctx_enc=info:ofi/enc:UTF-8&ctx_tim=2025-01-16T08%3A29%3A07IST&url_ver=Z39.88-2004&url_ctx_fmt=infofi/fmt:kev:mtx:ctx&rfr_id=info:sid/primo.exlibrisgroup.com:primo3-Article-epo_EVB&rft_val_fmt=info:ofi/fmt:kev:mtx:patent&rft.genre=patent&rft.au=VOLKOV%20YURIY,%20PETROVICH&rft.date=2016-01-29&rft_id=info:doi/&rft_dat=%3Cepo_EVB%3EEA022475B1%3C/epo_EVB%3E%3Curl%3E%3C/url%3E&disable_directlink=true&sfx.directlink=off&sfx.report_link=0&rft_id=info:oai/&rft_id=info:pmid/&rfr_iscdi=true