TILE LOCATION AND/OR CYCLE BASED WEIGHT SET SELECTION FOR BASE CALLING

A system for base calling includes memory storing a topology of a neural network, a plurality of weights sets, and sensor data for a series of sensing cycles. Sequencing events span temporal progression of the base calling operation through subseries of sensing cycles, and spatial progression of the...

Ausführliche Beschreibung

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Bibliographische Detailangaben
Hauptverfasser: PARNABY, GAVIN DEREK, HAHM, MARK DAVID, DU PREEZ, ANDREW CHRISTOPHER, KASHEAGHIGHI, DORNA, JAGANATHAN, KISHORE
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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Beschreibung
Zusammenfassung:A system for base calling includes memory storing a topology of a neural network, a plurality of weights sets, and sensor data for a series of sensing cycles. Sequencing events span temporal progression of the base calling operation through subseries of sensing cycles, and spatial progression of the base calling operation through locations on a biosensor. A configurable processor is configured to load the topology on the configurable processor, select a weight set in dependence upon a subject subseries of sensing cycles and/or a subject location on the biosensor, load subject sensor data for the subject subseries of sensing cycles and the subject location on the processing elements, configure the topology using the selected weight set, and cause the neural network to process the subject sensor data to produce base call classification data for the subject subseries and the subject location. Système d'appel de bases comprenant une mémoire stockant une topologie d'un réseau neuronal, une pluralité d'ensembles de poids, et des données de capteur pour une série de cycles de détection. Des événements de séquençage s'étendent sur une courbe temporelle de l'opération d'appel de base tout au long d'une sous-série de cycles de détection, et sur une courbe spatiale de l'opération d'appel de base à travers des emplacements sur un biocapteur. Un processeur configurable est configuré pour charger la topologie sur le processeur configurable, sélectionner un ensemble de poids en fonction d'une sous-série donnée de cycles de détection et/ou d'un emplacement donné sur le biocapteur, charger des données de capteur donné pour la sous-série donnée de cycles de détection et l'emplacement donné sur les éléments de traitement, configurer la topologie à l'aide de l'ensemble de poids sélectionné, et amener le réseau neuronal à traiter les données de capteur donné pour produire des données de classification d'appel de base pour la sous-série donnée et l'emplacement donné.