PCR METHOD AND PCR KIT FOR INCREASING ALLELIC DISCRIMINATION

The present invention relates to a method and a kit for detecting alleles of which the specificity and sensitivity in a DNA polymerase chain reaction (PCR), which is widely used for the detection of minor alleles such as single nucleotide polymorphisms or somatic mutations, are increased. More speci...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: BAEK, SEUNGWOO, LEE, BO MI, CHA, SUN HO, PARK, IN KYUNG, KIM, JAE JONG, LIM, SI-KYU, KYUNG, AYOUNG, RYU, JEOUNGHYUN
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator BAEK, SEUNGWOO
LEE, BO MI
CHA, SUN HO
PARK, IN KYUNG
KIM, JAE JONG
LIM, SI-KYU
KYUNG, AYOUNG
RYU, JEOUNGHYUN
description The present invention relates to a method and a kit for detecting alleles of which the specificity and sensitivity in a DNA polymerase chain reaction (PCR), which is widely used for the detection of minor alleles such as single nucleotide polymorphisms or somatic mutations, are increased. More specifically, the present invention relates to a PCR-based method and kit for single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping and somatic mutation detection, the method and kit adding a partially or fully double-stranded oligonucleotide for increasing discrimination to a PCR solution for selective amplification of alleles, so that PCR amplification is not affected when a primer 3' terminal base is complementary (3'-matched) to a template but PCR amplification is strongly inhibited when a 3' terminal base is not complementary (3'-mismatched). La présente invention concerne un procédé et un kit de détection d'allèles dont la spécificité et la sensibilité dans une réaction en chaîne par polymérase (PCR) d'ADN, qui est largement utilisée pour la détection d'allèles mineurs tels que des polymorphismes mononucléotidiques ou des mutations somatiques, sont augmentées. Plus spécifiquement, la présente invention concerne un procédé et un kit à base de PCR pour le génotypage de polymorphisme mononucléotidique (SNP) et la détection de mutation somatique, le procédé et le kit ajoutant partiellement ou totalement un oligonucléotide à double brin pour augmenter la discrimination d'une solution de PCR pour une amplification sélective d'allèles, de telle sorte que l'amplification par PCR n'est pas affectée lorsqu'une base d'amorce d'extrémité 3' terminale est complémentaire (appariée en 3') à une matrice mais l'amplification par PCR est fortement inhibée lorsqu'une base d'extrémité 3' terminale n'est pas complémentaire (mésappariée en 3').
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Plus spécifiquement, la présente invention concerne un procédé et un kit à base de PCR pour le génotypage de polymorphisme mononucléotidique (SNP) et la détection de mutation somatique, le procédé et le kit ajoutant partiellement ou totalement un oligonucléotide à double brin pour augmenter la discrimination d'une solution de PCR pour une amplification sélective d'allèles, de telle sorte que l'amplification par PCR n'est pas affectée lorsqu'une base d'amorce d'extrémité 3' terminale est complémentaire (appariée en 3') à une matrice mais l'amplification par PCR est fortement inhibée lorsqu'une base d'extrémité 3' terminale n'est pas complémentaire (mésappariée en 3').</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2021</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20210617&amp;DB=EPODOC&amp;CC=CA&amp;NR=3164057A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20210617&amp;DB=EPODOC&amp;CC=CA&amp;NR=3164057A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>BAEK, SEUNGWOO</creatorcontrib><creatorcontrib>LEE, BO MI</creatorcontrib><creatorcontrib>CHA, SUN HO</creatorcontrib><creatorcontrib>PARK, IN KYUNG</creatorcontrib><creatorcontrib>KIM, JAE JONG</creatorcontrib><creatorcontrib>LIM, SI-KYU</creatorcontrib><creatorcontrib>KYUNG, AYOUNG</creatorcontrib><creatorcontrib>RYU, JEOUNGHYUN</creatorcontrib><title>PCR METHOD AND PCR KIT FOR INCREASING ALLELIC DISCRIMINATION</title><description>The present invention relates to a method and a kit for detecting alleles of which the specificity and sensitivity in a DNA polymerase chain reaction (PCR), which is widely used for the detection of minor alleles such as single nucleotide polymorphisms or somatic mutations, are increased. 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More specifically, the present invention relates to a PCR-based method and kit for single nucleotide polymorphism (SNP) genotyping and somatic mutation detection, the method and kit adding a partially or fully double-stranded oligonucleotide for increasing discrimination to a PCR solution for selective amplification of alleles, so that PCR amplification is not affected when a primer 3' terminal base is complementary (3'-matched) to a template but PCR amplification is strongly inhibited when a 3' terminal base is not complementary (3'-mismatched). La présente invention concerne un procédé et un kit de détection d'allèles dont la spécificité et la sensibilité dans une réaction en chaîne par polymérase (PCR) d'ADN, qui est largement utilisée pour la détection d'allèles mineurs tels que des polymorphismes mononucléotidiques ou des mutations somatiques, sont augmentées. Plus spécifiquement, la présente invention concerne un procédé et un kit à base de PCR pour le génotypage de polymorphisme mononucléotidique (SNP) et la détection de mutation somatique, le procédé et le kit ajoutant partiellement ou totalement un oligonucléotide à double brin pour augmenter la discrimination d'une solution de PCR pour une amplification sélective d'allèles, de telle sorte que l'amplification par PCR n'est pas affectée lorsqu'une base d'amorce d'extrémité 3' terminale est complémentaire (appariée en 3') à une matrice mais l'amplification par PCR est fortement inhibée lorsqu'une base d'extrémité 3' terminale n'est pas complémentaire (mésappariée en 3').</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
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