DETECTION METHOD FOR NATURAL AND MODIFIED SMALL NUCLEIC ACIDS

The invention relates to a method for the detection of natural or modified nucleic acids by their sequence specific hybridization with charge-modified oligonucleotide probes having charge-modifying groups attached to their backbones. The charge-modifying groups partially or fully neutralize the net negative charge of the backbone of the oligonucleotide probes or render them with a net positive charge. The charge-modified oligonucleotide probes may or may not be labeled, for example, with fluorescent, visible or near-infrared dye, with radioactive or stable isotopes, or with high specific affinity binding groups. The charge- modified oligonucleotide probes facilitate the separation of their hybrids with the targeted nucleic acids from the unhybridized probes or from any other components of the analyzed sample. They also allow for the modification and optimization of the properties of the hybrids with the targeted nucleic acids, such as melting temperature, chromatographic properties and off-target specificity. L'invention concerne un procédé de détection d'acides nucléiques naturels ou modifiés par leur hybridation spécifique de séquence avec des sondes oligonucléotidiques à charge modifiée ayant des groupes de modification de charge fixés à leurs squelettes. Les groupes de modification de charge neutralisent partiellement ou complètement la charge négative nette du squelette des sondes oligonucléotidiques ou les transforment à charge positive nette. Les sondes oligonucléotidiques à charge modifiée peuvent être marquées ou non, par exemple, avec un colorant fluorescent, visible ou proche infrarouge, avec des isotopes radioactifs ou stables, ou avec des groupes de liaison d'affinité spécifiques élevés. Les sondes oligonucléotidiques à charge modifiée facilitent la séparation de leurs hybrides pourvus des acides nucléiques ciblés à partir des sondes non hybridées ou de tout autre composant de l'échantillon analysé. Elles permettent également la modification et l'optimisation des propriétés des hybrides pourvus des acides nucléiques ciblés, telles que la température de fusion, les propriétés chromatographiques et la spécificité hors cible.