METHODS FOR MICROBIAL IDENTIFICATION IN CLINICAL SPECIMENS BY DIFFERENTIAL RIBOSOMAL RNA PROBE HYBRIDIZATION

A method of identifying a target microbe in a specimen and including the steps of a) obtaining a specimen, b) lysing the specimen to release a plurality of rRNA molecules from one or more first target microbes in the specimen; c) contacting the specimen with a plurality of first oligonucleotide prob...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: MONTI, GABRIEL, HALFORD, COLIN WYNN, KNAUF, ROGER, CHURCHMAN, SCOTT ADAM, HAAKE, DAVID ARNOLD, CHURCHILL, BERNARD
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator MONTI, GABRIEL
HALFORD, COLIN WYNN
KNAUF, ROGER
CHURCHMAN, SCOTT ADAM
HAAKE, DAVID ARNOLD
CHURCHILL, BERNARD
description A method of identifying a target microbe in a specimen and including the steps of a) obtaining a specimen, b) lysing the specimen to release a plurality of rRNA molecules from one or more first target microbes in the specimen; c) contacting the specimen with a plurality of first oligonucleotide probe sets configured to selectively bind to rRNA molecules released from the target microbe thereby forming a plurality of first hybridized complexes, each first hybridized complex including one first capture probe and one first detector probe and one of the plurality of rRNA molecules, and d) analyzing the first hybridized complexes to identify a first target microbe in the specimen. L'invention concerne un procédé d'identification d'un microbe cible dans un échantillon et comprend les étapes consistant à : a) obtenir un échantillon, b) lyser l'échantillon pour libérer une pluralité de molécules d'ARNr à partir d'un ou de plusieurs premiers microbes cibles dans l'échantillon ; c) mettre en contact l'échantillon avec une pluralité de premiers ensembles de sondes oligonucléotidiques configurés pour se lier sélectivement à des molécules d'ARNr libérées par le microbe cible, formant ainsi une pluralité de premiers complexes hybridés, chaque premier complexe hybridé comprenant une première sonde de capture et une première sonde de détection et l'une de la pluralité de molécules d'ARNr, et d) analyser les premiers complexes hybridés pour identifier un premier microbe cible dans l'échantillon.
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L'invention concerne un procédé d'identification d'un microbe cible dans un échantillon et comprend les étapes consistant à : a) obtenir un échantillon, b) lyser l'échantillon pour libérer une pluralité de molécules d'ARNr à partir d'un ou de plusieurs premiers microbes cibles dans l'échantillon ; c) mettre en contact l'échantillon avec une pluralité de premiers ensembles de sondes oligonucléotidiques configurés pour se lier sélectivement à des molécules d'ARNr libérées par le microbe cible, formant ainsi une pluralité de premiers complexes hybridés, chaque premier complexe hybridé comprenant une première sonde de capture et une première sonde de détection et l'une de la pluralité de molécules d'ARNr, et d) analyser les premiers complexes hybridés pour identifier un premier microbe cible dans l'échantillon.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; DERIVATIVES THEREOF ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; NUCLEIC ACIDS ; NUCLEOSIDES ; NUCLEOTIDES ; ORGANIC CHEMISTRY ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; SUGARS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2019</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20191121&amp;DB=EPODOC&amp;CC=CA&amp;NR=3099741A1$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25563,76318</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20191121&amp;DB=EPODOC&amp;CC=CA&amp;NR=3099741A1$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>MONTI, GABRIEL</creatorcontrib><creatorcontrib>HALFORD, COLIN WYNN</creatorcontrib><creatorcontrib>KNAUF, ROGER</creatorcontrib><creatorcontrib>CHURCHMAN, SCOTT ADAM</creatorcontrib><creatorcontrib>HAAKE, DAVID ARNOLD</creatorcontrib><creatorcontrib>CHURCHILL, BERNARD</creatorcontrib><title>METHODS FOR MICROBIAL IDENTIFICATION IN CLINICAL SPECIMENS BY DIFFERENTIAL RIBOSOMAL RNA PROBE HYBRIDIZATION</title><description>A method of identifying a target microbe in a specimen and including the steps of a) obtaining a specimen, b) lysing the specimen to release a plurality of rRNA molecules from one or more first target microbes in the specimen; c) contacting the specimen with a plurality of first oligonucleotide probe sets configured to selectively bind to rRNA molecules released from the target microbe thereby forming a plurality of first hybridized complexes, each first hybridized complex including one first capture probe and one first detector probe and one of the plurality of rRNA molecules, and d) analyzing the first hybridized complexes to identify a first target microbe in the specimen. L'invention concerne un procédé d'identification d'un microbe cible dans un échantillon et comprend les étapes consistant à : a) obtenir un échantillon, b) lyser l'échantillon pour libérer une pluralité de molécules d'ARNr à partir d'un ou de plusieurs premiers microbes cibles dans l'échantillon ; c) mettre en contact l'échantillon avec une pluralité de premiers ensembles de sondes oligonucléotidiques configurés pour se lier sélectivement à des molécules d'ARNr libérées par le microbe cible, formant ainsi une pluralité de premiers complexes hybridés, chaque premier complexe hybridé comprenant une première sonde de capture et une première sonde de détection et l'une de la pluralité de molécules d'ARNr, et d) analyser les premiers complexes hybridés pour identifier un premier microbe cible dans l'échantillon.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>DERIVATIVES THEREOF</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>NUCLEIC ACIDS</subject><subject>NUCLEOSIDES</subject><subject>NUCLEOTIDES</subject><subject>ORGANIC CHEMISTRY</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>SUGARS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2019</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNqNjE0KwjAUhLtxIeod3gUESwXpMj8vdKBJSpKNbkqRuCpaqPfHVjyAq5lhPr5tMVpOjdeRjA9koYKXEC1Bs0swUCLBO4Ij1cIts6XYsYJlF0leScMYDiu7PAHSR2_X5gR1i4qpucoAjdvXsy82j2Gc8-GXu4IMJ9Uc8_Tq8zwN9_zM716J6lTXl3MpyuoP5AOTxjZY</recordid><startdate>20191121</startdate><enddate>20191121</enddate><creator>MONTI, GABRIEL</creator><creator>HALFORD, COLIN WYNN</creator><creator>KNAUF, ROGER</creator><creator>CHURCHMAN, SCOTT ADAM</creator><creator>HAAKE, DAVID ARNOLD</creator><creator>CHURCHILL, BERNARD</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20191121</creationdate><title>METHODS FOR MICROBIAL IDENTIFICATION IN CLINICAL SPECIMENS BY DIFFERENTIAL RIBOSOMAL RNA PROBE HYBRIDIZATION</title><author>MONTI, GABRIEL ; 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c) contacting the specimen with a plurality of first oligonucleotide probe sets configured to selectively bind to rRNA molecules released from the target microbe thereby forming a plurality of first hybridized complexes, each first hybridized complex including one first capture probe and one first detector probe and one of the plurality of rRNA molecules, and d) analyzing the first hybridized complexes to identify a first target microbe in the specimen. L'invention concerne un procédé d'identification d'un microbe cible dans un échantillon et comprend les étapes consistant à : a) obtenir un échantillon, b) lyser l'échantillon pour libérer une pluralité de molécules d'ARNr à partir d'un ou de plusieurs premiers microbes cibles dans l'échantillon ; c) mettre en contact l'échantillon avec une pluralité de premiers ensembles de sondes oligonucléotidiques configurés pour se lier sélectivement à des molécules d'ARNr libérées par le microbe cible, formant ainsi une pluralité de premiers complexes hybridés, chaque premier complexe hybridé comprenant une première sonde de capture et une première sonde de détection et l'une de la pluralité de molécules d'ARNr, et d) analyser les premiers complexes hybridés pour identifier un premier microbe cible dans l'échantillon.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
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