SINGLE NUCLEOTIDE DETECTION METHOD

A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base w...

Ausführliche Beschreibung

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Hauptverfasser: ISAAC, THOMAS HENRY, NATALE, ALESSANDRA, AMASIO, MICHELE, FRAYLING, CAMERON ALEXANDER, DEAR, PAUL, SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA, BALMFORTH, BARNABY, BREINER, BORIS
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator ISAAC, THOMAS HENRY
NATALE, ALESSANDRA
AMASIO, MICHELE
FRAYLING, CAMERON ALEXANDER
DEAR, PAUL
SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA
BALMFORTH, BARNABY
BREINER, BORIS
description A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base with a capture system labelled with detectable elements in an undetectable state; (3) releasing the detectable elements from each captured molecule in a detectable state and (4) detecting the detectable elements so released and determining the sequence of nucleotide bases therefrom. The method can be used advantageously in sequencers involving the use of microdroplets. La présente invention concerne un procédé de détermination de la séquence de bases nucléotidiques dans un analyte polynucléotidique. Celui-ci est caractérisé par les étapes de (1) génération d'un flux de bases nucléotidiques simples à partir de l'analyte par pyrophosphorolyse ; (2) production de molécules capturées par réaction de chaque base nucléotidique simple avec un système de capture marqué avec des éléments détectables dans un état indétectable ; (3) libération des éléments détectables à partir de chaque molécule capturée dans un état détectable et (4) détection des éléments détectables libérés ainsi et détermination de la séquence de bases nucléotidiques à partir de ceux-ci. Le procédé peut être utilisé avantageusement dans des séquenceurs mettant en uvre l'utilisation de microgouttelettes.
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It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base with a capture system labelled with detectable elements in an undetectable state; (3) releasing the detectable elements from each captured molecule in a detectable state and (4) detecting the detectable elements so released and determining the sequence of nucleotide bases therefrom. The method can be used advantageously in sequencers involving the use of microdroplets. La présente invention concerne un procédé de détermination de la séquence de bases nucléotidiques dans un analyte polynucléotidique. Celui-ci est caractérisé par les étapes de (1) génération d'un flux de bases nucléotidiques simples à partir de l'analyte par pyrophosphorolyse ; (2) production de molécules capturées par réaction de chaque base nucléotidique simple avec un système de capture marqué avec des éléments détectables dans un état indétectable ; (3) libération des éléments détectables à partir de chaque molécule capturée dans un état détectable et (4) détection des éléments détectables libérés ainsi et détermination de la séquence de bases nucléotidiques à partir de ceux-ci. 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