SINGLE NUCLEOTIDE DETECTION METHOD
A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base w...
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Format: | Patent |
Sprache: | eng ; fre |
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creator | ISAAC, THOMAS HENRY NATALE, ALESSANDRA AMASIO, MICHELE FRAYLING, CAMERON ALEXANDER DEAR, PAUL SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA BALMFORTH, BARNABY BREINER, BORIS |
description | A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base with a capture system labelled with detectable elements in an undetectable state; (3) releasing the detectable elements from each captured molecule in a detectable state and (4) detecting the detectable elements so released and determining the sequence of nucleotide bases therefrom. The method can be used advantageously in sequencers involving the use of microdroplets.
La présente invention concerne un procédé de détermination de la séquence de bases nucléotidiques dans un analyte polynucléotidique. Celui-ci est caractérisé par les étapes de (1) génération d'un flux de bases nucléotidiques simples à partir de l'analyte par pyrophosphorolyse ; (2) production de molécules capturées par réaction de chaque base nucléotidique simple avec un système de capture marqué avec des éléments détectables dans un état indétectable ; (3) libération des éléments détectables à partir de chaque molécule capturée dans un état détectable et (4) détection des éléments détectables libérés ainsi et détermination de la séquence de bases nucléotidiques à partir de ceux-ci. Le procédé peut être utilisé avantageusement dans des séquenceurs mettant en uvre l'utilisation de microgouttelettes. |
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La présente invention concerne un procédé de détermination de la séquence de bases nucléotidiques dans un analyte polynucléotidique. Celui-ci est caractérisé par les étapes de (1) génération d'un flux de bases nucléotidiques simples à partir de l'analyte par pyrophosphorolyse ; (2) production de molécules capturées par réaction de chaque base nucléotidique simple avec un système de capture marqué avec des éléments détectables dans un état indétectable ; (3) libération des éléments détectables à partir de chaque molécule capturée dans un état détectable et (4) détection des éléments détectables libérés ainsi et détermination de la séquence de bases nucléotidiques à partir de ceux-ci. Le procédé peut être utilisé avantageusement dans des séquenceurs mettant en uvre l'utilisation de microgouttelettes.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR ; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES ; ENZYMOLOGY ; MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2018</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20180227&DB=EPODOC&CC=CA&NR=2907865C$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,780,885,25564,76547</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&date=20180227&DB=EPODOC&CC=CA&NR=2907865C$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>ISAAC, THOMAS HENRY</creatorcontrib><creatorcontrib>NATALE, ALESSANDRA</creatorcontrib><creatorcontrib>AMASIO, MICHELE</creatorcontrib><creatorcontrib>FRAYLING, CAMERON ALEXANDER</creatorcontrib><creatorcontrib>DEAR, PAUL</creatorcontrib><creatorcontrib>SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA</creatorcontrib><creatorcontrib>BALMFORTH, BARNABY</creatorcontrib><creatorcontrib>BREINER, BORIS</creatorcontrib><title>SINGLE NUCLEOTIDE DETECTION METHOD</title><description>A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base with a capture system labelled with detectable elements in an undetectable state; (3) releasing the detectable elements from each captured molecule in a detectable state and (4) detecting the detectable elements so released and determining the sequence of nucleotide bases therefrom. The method can be used advantageously in sequencers involving the use of microdroplets.
La présente invention concerne un procédé de détermination de la séquence de bases nucléotidiques dans un analyte polynucléotidique. Celui-ci est caractérisé par les étapes de (1) génération d'un flux de bases nucléotidiques simples à partir de l'analyte par pyrophosphorolyse ; (2) production de molécules capturées par réaction de chaque base nucléotidique simple avec un système de capture marqué avec des éléments détectables dans un état indétectable ; (3) libération des éléments détectables à partir de chaque molécule capturée dans un état détectable et (4) détection des éléments détectables libérés ainsi et détermination de la séquence de bases nucléotidiques à partir de ceux-ci. Le procédé peut être utilisé avantageusement dans des séquenceurs mettant en uvre l'utilisation de microgouttelettes.</description><subject>BEER</subject><subject>BIOCHEMISTRY</subject><subject>CHEMISTRY</subject><subject>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</subject><subject>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</subject><subject>ENZYMOLOGY</subject><subject>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</subject><subject>METALLURGY</subject><subject>MICROBIOLOGY</subject><subject>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</subject><subject>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</subject><subject>SPIRITS</subject><subject>VINEGAR</subject><subject>WINE</subject><fulltext>true</fulltext><rsrctype>patent</rsrctype><creationdate>2018</creationdate><recordtype>patent</recordtype><sourceid>EVB</sourceid><recordid>eNrjZFAK9vRz93FV8At19nH1D_F0cVVwcQ1xdQ7x9PdT8HUN8fB34WFgTUvMKU7lhdLcDPJuriHOHrqpBfnxqcUFicmpeakl8c6ORpYG5hZmps7GhFUAALhiIac</recordid><startdate>20180227</startdate><enddate>20180227</enddate><creator>ISAAC, THOMAS HENRY</creator><creator>NATALE, ALESSANDRA</creator><creator>AMASIO, MICHELE</creator><creator>FRAYLING, CAMERON ALEXANDER</creator><creator>DEAR, PAUL</creator><creator>SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA</creator><creator>BALMFORTH, BARNABY</creator><creator>BREINER, BORIS</creator><scope>EVB</scope></search><sort><creationdate>20180227</creationdate><title>SINGLE NUCLEOTIDE DETECTION METHOD</title><author>ISAAC, THOMAS HENRY ; NATALE, ALESSANDRA ; AMASIO, MICHELE ; FRAYLING, CAMERON ALEXANDER ; DEAR, PAUL ; SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA ; BALMFORTH, BARNABY ; BREINER, BORIS</author></sort><facets><frbrtype>5</frbrtype><frbrgroupid>cdi_FETCH-epo_espacenet_CA2907865C3</frbrgroupid><rsrctype>patents</rsrctype><prefilter>patents</prefilter><language>eng ; fre</language><creationdate>2018</creationdate><topic>BEER</topic><topic>BIOCHEMISTRY</topic><topic>CHEMISTRY</topic><topic>COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR</topic><topic>CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL ORENZYMOLOGICAL PROCESSES</topic><topic>ENZYMOLOGY</topic><topic>MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEICACIDS OR MICROORGANISMS</topic><topic>METALLURGY</topic><topic>MICROBIOLOGY</topic><topic>MUTATION OR GENETIC ENGINEERING</topic><topic>PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS</topic><topic>SPIRITS</topic><topic>VINEGAR</topic><topic>WINE</topic><toplevel>online_resources</toplevel><creatorcontrib>ISAAC, THOMAS HENRY</creatorcontrib><creatorcontrib>NATALE, ALESSANDRA</creatorcontrib><creatorcontrib>AMASIO, MICHELE</creatorcontrib><creatorcontrib>FRAYLING, CAMERON ALEXANDER</creatorcontrib><creatorcontrib>DEAR, PAUL</creatorcontrib><creatorcontrib>SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA</creatorcontrib><creatorcontrib>BALMFORTH, BARNABY</creatorcontrib><creatorcontrib>BREINER, BORIS</creatorcontrib><collection>esp@cenet</collection></facets><delivery><delcategory>Remote Search Resource</delcategory><fulltext>fulltext_linktorsrc</fulltext></delivery><addata><au>ISAAC, THOMAS HENRY</au><au>NATALE, ALESSANDRA</au><au>AMASIO, MICHELE</au><au>FRAYLING, CAMERON ALEXANDER</au><au>DEAR, PAUL</au><au>SOARES, BRUNO FLAVIO NOGUEIRA DE SOUSA</au><au>BALMFORTH, BARNABY</au><au>BREINER, BORIS</au><format>patent</format><genre>patent</genre><ristype>GEN</ristype><title>SINGLE NUCLEOTIDE DETECTION METHOD</title><date>2018-02-27</date><risdate>2018</risdate><abstract>A method for determining the sequence of nucleotide bases in a polynucleotide analyte is provided. It is characterised by the steps of (1) generating a stream of single nucleotide bases from the analyte by pyrophosphorolysis; (2) producing captured molecules by reacting each single nucleotide base with a capture system labelled with detectable elements in an undetectable state; (3) releasing the detectable elements from each captured molecule in a detectable state and (4) detecting the detectable elements so released and determining the sequence of nucleotide bases therefrom. The method can be used advantageously in sequencers involving the use of microdroplets.
La présente invention concerne un procédé de détermination de la séquence de bases nucléotidiques dans un analyte polynucléotidique. Celui-ci est caractérisé par les étapes de (1) génération d'un flux de bases nucléotidiques simples à partir de l'analyte par pyrophosphorolyse ; (2) production de molécules capturées par réaction de chaque base nucléotidique simple avec un système de capture marqué avec des éléments détectables dans un état indétectable ; (3) libération des éléments détectables à partir de chaque molécule capturée dans un état détectable et (4) détection des éléments détectables libérés ainsi et détermination de la séquence de bases nucléotidiques à partir de ceux-ci. Le procédé peut être utilisé avantageusement dans des séquenceurs mettant en uvre l'utilisation de microgouttelettes.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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