IMPROVED METHODS FOR TRANSFORMING PHAFFIA STRAINS, TRANSFORMED PHAFFIA STRAINS SO OBTAINED AND RECOMBINANT DNA IN SAID METHODS

The present invention provides recombinant DNA comprising a transcription promoter and a downstream sequence to be expressed, in operable linkage therewith, wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame of a highly expressed Phaffia gene, preferably a...

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Hauptverfasser: VAN OOIJEN, ALBERT JOHANNES JOSEPH, VERDOES, JAN CORNELIS, WERY, JAN
Format: Patent
Sprache:eng ; fre
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creator VAN OOIJEN, ALBERT JOHANNES JOSEPH
VERDOES, JAN CORNELIS
WERY, JAN
description The present invention provides recombinant DNA comprising a transcription promoter and a downstream sequence to be expressed, in operable linkage therewith, wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame of a highly expressed Phaffia gene, preferably a glycolytic pathway gene, more preferably the gene coding for Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase. Further preferred recombinant DNAs according to the invention contain promoters of ribosomal protein encoding genes, more preferably wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame encoding a protein as represented by one of the amino acid sequences depicted in any one of SEQIDNOs: 24 to 50. According to a further aspect of the invention an isolated DNA sequence coding for an enzyme involved in the carotenoid biosynthetic pathway of Phaffia rhodozyma is provided, preferably wherein said enzyme has an activity selected from isopentenyl pyrophosphate isomerase activity, geranylgeranyl pyrophosphate synthase activity, phytoene synthase activity, phytoene desaturase activity and lycopene cyclase activity, still more preferably those coding for an enzyme having an amino acid sequence selected from the one represented by SEQIDNO: 13, SEQIDNO: 15, SEQIDNO: 17, SEQIDNO: 19, SEQIDNO: 21 or SEQIDNO: 23. Further embodiments concern vectors, transformed host organisms, methods for making proteins and/or carotenoids, such as astaxanthin, and methods for isolating highly expressed promoters from Phaffia. La présente invention concerne un ADN de recombinaison comprenant un promoteur de transcription, une séquence en aval à exprimer, liée de façon opérationnelle avec ce dernier, le promoteur de transcription comprenant une région située en amont du cadre de lecture ouvert d'un gène de Phaffia fortement exprimé, de préférence un gène intervenant dans un processus glycolytique, ou encore mieux, le gène codant la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase. D'autres ADN de recombinaison préférés, selon l'invention, contiennent des promoteurs de gènes codant une protéine ribosomique, ou encore mieux, le promoteur de transcription comprenant une région située en amont du cadre de lecture ouvert codant une protéine représentée par l'une des séquences d'acides aminés décrites dans l'une des séquences portant le numéro d'identification 24 à 50. Selon un autre aspect de l'invention, on décrit une séquence d'ADN isolé codant une enzyme impli
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Further preferred recombinant DNAs according to the invention contain promoters of ribosomal protein encoding genes, more preferably wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame encoding a protein as represented by one of the amino acid sequences depicted in any one of SEQIDNOs: 24 to 50. According to a further aspect of the invention an isolated DNA sequence coding for an enzyme involved in the carotenoid biosynthetic pathway of Phaffia rhodozyma is provided, preferably wherein said enzyme has an activity selected from isopentenyl pyrophosphate isomerase activity, geranylgeranyl pyrophosphate synthase activity, phytoene synthase activity, phytoene desaturase activity and lycopene cyclase activity, still more preferably those coding for an enzyme having an amino acid sequence selected from the one represented by SEQIDNO: 13, SEQIDNO: 15, SEQIDNO: 17, SEQIDNO: 19, SEQIDNO: 21 or SEQIDNO: 23. Further embodiments concern vectors, transformed host organisms, methods for making proteins and/or carotenoids, such as astaxanthin, and methods for isolating highly expressed promoters from Phaffia. La présente invention concerne un ADN de recombinaison comprenant un promoteur de transcription, une séquence en aval à exprimer, liée de façon opérationnelle avec ce dernier, le promoteur de transcription comprenant une région située en amont du cadre de lecture ouvert d'un gène de Phaffia fortement exprimé, de préférence un gène intervenant dans un processus glycolytique, ou encore mieux, le gène codant la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase. D'autres ADN de recombinaison préférés, selon l'invention, contiennent des promoteurs de gènes codant une protéine ribosomique, ou encore mieux, le promoteur de transcription comprenant une région située en amont du cadre de lecture ouvert codant une protéine représentée par l'une des séquences d'acides aminés décrites dans l'une des séquences portant le numéro d'identification 24 à 50. Selon un autre aspect de l'invention, on décrit une séquence d'ADN isolé codant une enzyme impliquée dans le processus de biosynthèse de caroténoïde de Phaffia rhodozyma, ladite enzyme présentant de préférence une activité sélectionnée parmi l'activité de l'isopenténylpyrophosphate isomérase, l'activité de la géranylgéranylpyrophosphate synthase, l'activité de la phytoène synthase, l'activité de la phytoène désaturase et l'activité de la lycopène cyclase, ou encore mieux, celles qui codent un enzyme présentant une séquence d'acides aminés choisie dans l'une des séquences portant le numéro d'identification 13, 15, 17, 19, 21, 23. L'invention concerne également des vecteurs, des organismes hôtes transformés, des méthodes pour produire ces protéines et/ou caroténoïdes, par exemple l'astaxanthine, ainsi que des méthodes pour isoler des promoteurs fortement exprimés à partir du Phaffia.</description><language>eng ; fre</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS THEREOF ; CULTURE MEDIA ; ENZYMOLOGY ; FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIREDCHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERSFROM A RACEMIC MIXTURE ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MICROORGANISMS OR ENZYMES ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; ORGANIC CHEMISTRY ; PEPTIDES ; PROCESSES USING MICROORGANISMS ; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2012</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20121204&amp;DB=EPODOC&amp;CC=CA&amp;NR=2241267C$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,777,882,25545,76296</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20121204&amp;DB=EPODOC&amp;CC=CA&amp;NR=2241267C$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>VAN OOIJEN, ALBERT JOHANNES JOSEPH</creatorcontrib><creatorcontrib>VERDOES, JAN CORNELIS</creatorcontrib><creatorcontrib>WERY, JAN</creatorcontrib><title>IMPROVED METHODS FOR TRANSFORMING PHAFFIA STRAINS, TRANSFORMED PHAFFIA STRAINS SO OBTAINED AND RECOMBINANT DNA IN SAID METHODS</title><description>The present invention provides recombinant DNA comprising a transcription promoter and a downstream sequence to be expressed, in operable linkage therewith, wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame of a highly expressed Phaffia gene, preferably a glycolytic pathway gene, more preferably the gene coding for Glyceraldehyde-3-Phosphate Dehydrogenase. Further preferred recombinant DNAs according to the invention contain promoters of ribosomal protein encoding genes, more preferably wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame encoding a protein as represented by one of the amino acid sequences depicted in any one of SEQIDNOs: 24 to 50. According to a further aspect of the invention an isolated DNA sequence coding for an enzyme involved in the carotenoid biosynthetic pathway of Phaffia rhodozyma is provided, preferably wherein said enzyme has an activity selected from isopentenyl pyrophosphate isomerase activity, geranylgeranyl pyrophosphate synthase activity, phytoene synthase activity, phytoene desaturase activity and lycopene cyclase activity, still more preferably those coding for an enzyme having an amino acid sequence selected from the one represented by SEQIDNO: 13, SEQIDNO: 15, SEQIDNO: 17, SEQIDNO: 19, SEQIDNO: 21 or SEQIDNO: 23. Further embodiments concern vectors, transformed host organisms, methods for making proteins and/or carotenoids, such as astaxanthin, and methods for isolating highly expressed promoters from Phaffia. La présente invention concerne un ADN de recombinaison comprenant un promoteur de transcription, une séquence en aval à exprimer, liée de façon opérationnelle avec ce dernier, le promoteur de transcription comprenant une région située en amont du cadre de lecture ouvert d'un gène de Phaffia fortement exprimé, de préférence un gène intervenant dans un processus glycolytique, ou encore mieux, le gène codant la glycéraldéhyde-3-phosphate déshydrogénase. 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Selon un autre aspect de l'invention, on décrit une séquence d'ADN isolé codant une enzyme impliquée dans le processus de biosynthèse de caroténoïde de Phaffia rhodozyma, ladite enzyme présentant de préférence une activité sélectionnée parmi l'activité de l'isopenténylpyrophosphate isomérase, l'activité de la géranylgéranylpyrophosphate synthase, l'activité de la phytoène synthase, l'activité de la phytoène désaturase et l'activité de la lycopène cyclase, ou encore mieux, celles qui codent un enzyme présentant une séquence d'acides aminés choisie dans l'une des séquences portant le numéro d'identification 13, 15, 17, 19, 21, 23. 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Further preferred recombinant DNAs according to the invention contain promoters of ribosomal protein encoding genes, more preferably wherein the transcription promoter comprises a region found upstream of the open reading frame encoding a protein as represented by one of the amino acid sequences depicted in any one of SEQIDNOs: 24 to 50. According to a further aspect of the invention an isolated DNA sequence coding for an enzyme involved in the carotenoid biosynthetic pathway of Phaffia rhodozyma is provided, preferably wherein said enzyme has an activity selected from isopentenyl pyrophosphate isomerase activity, geranylgeranyl pyrophosphate synthase activity, phytoene synthase activity, phytoene desaturase activity and lycopene cyclase activity, still more preferably those coding for an enzyme having an amino acid sequence selected from the one represented by SEQIDNO: 13, SEQIDNO: 15, SEQIDNO: 17, SEQIDNO: 19, SEQIDNO: 21 or SEQIDNO: 23. 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