método de ambientómica funcional para engenharia de meio de cultura celular

método de ambientómica funcional para engenharia de meio de cultura celular esta invenção refere-se a um novo método para a otimização da composição de um meio para a cultura de células. este novo método compreende duas fases principais. na primeira fase, constrói-se um mapa de ambientómica funciona...

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Hauptverfasser: ANA RAQUEL SANTOS FERREIRA, RUI MANUEL FREITAS OLIVEIRA, JOÃO MIGUEL LOPES DIAS
Format: Patent
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creator ANA RAQUEL SANTOS FERREIRA
RUI MANUEL FREITAS OLIVEIRA
JOÃO MIGUEL LOPES DIAS
description método de ambientómica funcional para engenharia de meio de cultura celular esta invenção refere-se a um novo método para a otimização da composição de um meio para a cultura de células. este novo método compreende duas fases principais. na primeira fase, constrói-se um mapa de ambientómica funcional através do rastreio conjunto de funções celulares e de fatores do meio através da realização de um protocolo de cultura celular específico e de um protocolo de testes de exometaboloma. o mapa de ambientómica funcional consiste numa matriz de dados de valores de intensidade de funções celulares elementares em relação a fatores do meio. na segunda fase, são desenvolvidas formulações optimizadas do meio de cultura celular ou aumentar ou inibir funções celulares elementares alvo a partir de colunas do mapa de ambientómica funcional. a principal vantagem deste método é a de permitir engenharia metabólica através da manipulação da composição do meio de cultura, em que se optimiza um número arbitrariamente elevado de funções celulares através da manipulação de fatores do meio, em contraste com métodos anteriores, os quais são eminentemente empíricos, não são orientados para as funções celulares, e necessitam de um número de experiências muuito superior. além disso, este novo método baseia-se em testes de exometaboloma e não necessita de testes genómicos ou proteómicos intracelulares onerosos. This invention refers to a new method for optimizing the composition of cell culture media. This new method comprises two main stages. In the first stage, a functional enviromics map is built through the joint screening of cell functions and medium factors by the execution of a specific cell culture protocol and exometabolome assays protocol. The functional enviromics map consists of a data array of intensity values of elementary cellular functions against medium factors. In the second stage, optimized cell culture medium formulations are developed that either enhance or repress target elementary cellular functions from columns of the functional enviromics map. The main advantage of this method lies in enabling metabolic engineering through the culture media composition manipulation, wherein an arbitrarily high number of cell functions are optimized through manipulation of medium factors, as opposed to previous methods, which are eminently empirical, are not cell function oriented, and require a much higher number of experiments. Furthermore, this new method is based on cost-eff
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This invention refers to a new method for optimizing the composition of cell culture media. This new method comprises two main stages. In the first stage, a functional enviromics map is built through the joint screening of cell functions and medium factors by the execution of a specific cell culture protocol and exometabolome assays protocol. The functional enviromics map consists of a data array of intensity values of elementary cellular functions against medium factors. In the second stage, optimized cell culture medium formulations are developed that either enhance or repress target elementary cellular functions from columns of the functional enviromics map. The main advantage of this method lies in enabling metabolic engineering through the culture media composition manipulation, wherein an arbitrarily high number of cell functions are optimized through manipulation of medium factors, as opposed to previous methods, which are eminently empirical, are not cell function oriented, and require a much higher number of experiments. Furthermore, this new method is based on cost-effective exometabolome assays and does not require costly intracellular genomic or proteomic assays.</description><language>por</language><subject>BEER ; BIOCHEMISTRY ; CHEMISTRY ; COMPOSITIONS THEREOF ; CULTURE MEDIA ; ENZYMOLOGY ; METALLURGY ; MICROBIOLOGY ; MICROORGANISMS OR ENZYMES ; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING ; PROPAGATING, PRESERVING OR MAINTAINING MICROORGANISMS ; SPIRITS ; VINEGAR ; WINE</subject><creationdate>2016</creationdate><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><linktohtml>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160920&amp;DB=EPODOC&amp;CC=BR&amp;NR=112013018075A2$$EHTML$$P50$$Gepo$$Hfree_for_read</linktohtml><link.rule.ids>230,308,777,882,25545,76296</link.rule.ids><linktorsrc>$$Uhttps://worldwide.espacenet.com/publicationDetails/biblio?FT=D&amp;date=20160920&amp;DB=EPODOC&amp;CC=BR&amp;NR=112013018075A2$$EView_record_in_European_Patent_Office$$FView_record_in_$$GEuropean_Patent_Office$$Hfree_for_read</linktorsrc></links><search><creatorcontrib>ANA RAQUEL SANTOS FERREIRA</creatorcontrib><creatorcontrib>RUI MANUEL FREITAS OLIVEIRA</creatorcontrib><creatorcontrib>JOÃO MIGUEL LOPES DIAS</creatorcontrib><title>método de ambientómica funcional para engenharia de meio de cultura celular</title><description>método de ambientómica funcional para engenharia de meio de cultura celular esta invenção refere-se a um novo método para a otimização da composição de um meio para a cultura de células. este novo método compreende duas fases principais. na primeira fase, constrói-se um mapa de ambientómica funcional através do rastreio conjunto de funções celulares e de fatores do meio através da realização de um protocolo de cultura celular específico e de um protocolo de testes de exometaboloma. o mapa de ambientómica funcional consiste numa matriz de dados de valores de intensidade de funções celulares elementares em relação a fatores do meio. na segunda fase, são desenvolvidas formulações optimizadas do meio de cultura celular ou aumentar ou inibir funções celulares elementares alvo a partir de colunas do mapa de ambientómica funcional. a principal vantagem deste método é a de permitir engenharia metabólica através da manipulação da composição do meio de cultura, em que se optimiza um número arbitrariamente elevado de funções celulares através da manipulação de fatores do meio, em contraste com métodos anteriores, os quais são eminentemente empíricos, não são orientados para as funções celulares, e necessitam de um número de experiências muuito superior. além disso, este novo método baseia-se em testes de exometaboloma e não necessita de testes genómicos ou proteómicos intracelulares onerosos. This invention refers to a new method for optimizing the composition of cell culture media. This new method comprises two main stages. In the first stage, a functional enviromics map is built through the joint screening of cell functions and medium factors by the execution of a specific cell culture protocol and exometabolome assays protocol. The functional enviromics map consists of a data array of intensity values of elementary cellular functions against medium factors. In the second stage, optimized cell culture medium formulations are developed that either enhance or repress target elementary cellular functions from columns of the functional enviromics map. The main advantage of this method lies in enabling metabolic engineering through the culture media composition manipulation, wherein an arbitrarily high number of cell functions are optimized through manipulation of medium factors, as opposed to previous methods, which are eminently empirical, are not cell function oriented, and require a much higher number of experiments. 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This invention refers to a new method for optimizing the composition of cell culture media. This new method comprises two main stages. In the first stage, a functional enviromics map is built through the joint screening of cell functions and medium factors by the execution of a specific cell culture protocol and exometabolome assays protocol. The functional enviromics map consists of a data array of intensity values of elementary cellular functions against medium factors. In the second stage, optimized cell culture medium formulations are developed that either enhance or repress target elementary cellular functions from columns of the functional enviromics map. The main advantage of this method lies in enabling metabolic engineering through the culture media composition manipulation, wherein an arbitrarily high number of cell functions are optimized through manipulation of medium factors, as opposed to previous methods, which are eminently empirical, are not cell function oriented, and require a much higher number of experiments. Furthermore, this new method is based on cost-effective exometabolome assays and does not require costly intracellular genomic or proteomic assays.</abstract><oa>free_for_read</oa></addata></record>
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