METODO PARA EL DISENO DE OLIGONUCLEOTIDOS PARA TECNICAS DE BIOLOGIA MOLECULAR

La presente divulga un método que puede ser usado para identificar una o un grupo específico de secuencias de ADN desde una muestra biologica compleja. Diversos métodos de la biología molecular requieren el uso de secuencias cortas de ADN, llamadas oligonucleotidos, que se sintetizan artificialmente a partir de una descripcion de las bases que las componen. El método reivindicado permite disenar oligonucleotidos utiles en dichos procedimientos de biología molecular, tales como el diseno de sondas y está caracterizado por la construccion de una base de datos de secuencias de referencia, la seleccion de un subconjunto de secuencias correspondientes a los organismos de interés, la seleccion a partir de estas secuencias de oligonucleotidos candidatos, la depuracion de estos oligonucleotidos candidatos de acuerdo a criterios de especificidad en la hibridacion y de estabilidad termodinámica, y la ordenacion de éstos de acuerdo a la especificidad taxonomica. En un segundo aspecto se protege un método para disenar pares de oligonucleotidos, los que se requieren en algunas técnicas de biología molecular, tal como la técnica de reaccion en cadena de polimerasa (PCR). Esté método es similar al anterior pero se evaluan pares de oligonucleotidos compatibles termodinámicamente que hibridan sobre una misma secuencia a una distancia de un rango determinado. Designing oligonucleotides used in molecular biology process comprises selecting/creating a data base of reference sequences, i.e. an evaluating data base, selecting a subset of sequences of a desired organism to create a reference data base, i.e. a design data base, selecting oligonucleotides to be examined from the subset of sequences, purifying the selected oligonucleotides as per the criteria of hybridization specificity and thermodynamic stability and obtaining a list of oligonucleotides that satisfies all the above conditions to give oligonucleotides obtained by the method.