Detección de regiones genómicas con elevado desequilibrio de ligamiento en poblaciones de vacuno de carne españolas con análisis de BovineHD BeadChip
El objetivo de este trabajo fue evaluar el patrón de desequilibrio de ligamiento a lo largo del genoma en siete poblaciones españolas autóctonas de vacuno de carne (Asturiana de los Valles, Avileña Negra-Ibérica, Bruna dels Pirineus, Morucha, Pirenaica, Retinta y Rubia Gallega). Para ello, se utiliz...
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| Veröffentlicht in: | Archivos de Zootecnia 2017, Vol.66 (253), p.59-65 |
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| Online-Zugang: | Volltext |
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| creator | Mouresan, E.F. González-Rodríguez, A. Munilla, S. Moreno, C. Altarriba, J. Díaz, C. Baro, J.A. Piedrafita, J. Molina, A. Cañas-Álvarez, J.J. Varona, L. |
| description | El objetivo de este trabajo fue evaluar el patrón de desequilibrio de ligamiento a lo largo del genoma en siete poblaciones españolas autóctonas de vacuno de carne (Asturiana de los Valles, Avileña Negra-Ibérica, Bruna dels Pirineus, Morucha, Pirenaica, Retinta y Rubia Gallega). Para ello, se utilizó el BovineHD BeadChip con el que se genotiparon 171 tríos formados por individuo/padre/madre. Después del filtrado, se dispuso de 573.134 SNP. A partir de esta información se definió un parámetro que mide el desequilibrio medio del genoma por regiones de 1Mb en cada una de las poblaciones. Los resultados mostraron que el desequilibrio de ligamiento es muy heterogéneo a lo largo del genoma y que, además, esta heterogeneidad es consistente entre poblaciones. Las causas de esta heterogeneidad pueden ser, o bien estructurales y atribuibles a una menor tasa de mutación y/o recombinación, o bien consecuencia de procesos de selección estabilizadora. |
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Para ello, se utilizó el BovineHD BeadChip con el que se genotiparon 171 tríos formados por individuo/padre/madre. Después del filtrado, se dispuso de 573.134 SNP. A partir de esta información se definió un parámetro que mide el desequilibrio medio del genoma por regiones de 1Mb en cada una de las poblaciones. Los resultados mostraron que el desequilibrio de ligamiento es muy heterogéneo a lo largo del genoma y que, además, esta heterogeneidad es consistente entre poblaciones. Las causas de esta heterogeneidad pueden ser, o bien estructurales y atribuibles a una menor tasa de mutación y/o recombinación, o bien consecuencia de procesos de selección estabilizadora.</description><identifier>ISSN: 1885-4494</identifier><identifier>ISSN: 0004-0592</identifier><identifier>EISSN: 1885-4494</identifier><identifier>DOI: 10.21071/az.v66i253.2126</identifier><language>eng ; spa</language><subject>Beef cattle ; Desequilibrio de ligamiento ; Linkage disequilibrium ; Vacuno de carne</subject><ispartof>Archivos de Zootecnia, 2017, Vol.66 (253), p.59-65</ispartof><rights>LICENCIA DE USO: Los documentos a texto completo incluidos en Dialnet son de acceso libre y propiedad de sus autores y/o editores. Por tanto, cualquier acto de reproducción, distribución, comunicación pública y/o transformación total o parcial requiere el consentimiento expreso y escrito de aquéllos. Cualquier enlace al texto completo de estos documentos deberá hacerse a través de la URL oficial de éstos en Dialnet. Más información: https://dialnet.unirioja.es/info/derechosOAI | INTELLECTUAL PROPERTY RIGHTS STATEMENT: Full text documents hosted by Dialnet are protected by copyright and/or related rights. This digital object is accessible without charge, but its use is subject to the licensing conditions set by its authors or editors. Unless expressly stated otherwise in the licensing conditions, you are free to linking, browsing, printing and making a copy for your own personal purposes. All other acts of reproduction and communication to the public are subject to the licensing conditions expressed by editors and authors and require consent from them. Any link to this document should be made using its official URL in Dialnet. More info: https://dialnet.unirioja.es/info/derechosOAI</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,780,784,864,874,4024,27923,27924,27925</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Mouresan, E.F.</creatorcontrib><creatorcontrib>González-Rodríguez, A.</creatorcontrib><creatorcontrib>Munilla, S.</creatorcontrib><creatorcontrib>Moreno, C.</creatorcontrib><creatorcontrib>Altarriba, J.</creatorcontrib><creatorcontrib>Díaz, C.</creatorcontrib><creatorcontrib>Baro, J.A.</creatorcontrib><creatorcontrib>Piedrafita, J.</creatorcontrib><creatorcontrib>Molina, A.</creatorcontrib><creatorcontrib>Cañas-Álvarez, J.J.</creatorcontrib><creatorcontrib>Varona, L.</creatorcontrib><title>Detección de regiones genómicas con elevado desequilibrio de ligamiento en poblaciones de vacuno de carne españolas con análisis de BovineHD BeadChip</title><title>Archivos de Zootecnia</title><description>El objetivo de este trabajo fue evaluar el patrón de desequilibrio de ligamiento a lo largo del genoma en siete poblaciones españolas autóctonas de vacuno de carne (Asturiana de los Valles, Avileña Negra-Ibérica, Bruna dels Pirineus, Morucha, Pirenaica, Retinta y Rubia Gallega). Para ello, se utilizó el BovineHD BeadChip con el que se genotiparon 171 tríos formados por individuo/padre/madre. Después del filtrado, se dispuso de 573.134 SNP. A partir de esta información se definió un parámetro que mide el desequilibrio medio del genoma por regiones de 1Mb en cada una de las poblaciones. Los resultados mostraron que el desequilibrio de ligamiento es muy heterogéneo a lo largo del genoma y que, además, esta heterogeneidad es consistente entre poblaciones. 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