Antitumor activity of Actinobacteria isolated in marine sediment from Todos Santos Bay, Baja California, Mexico

The bioactivity of culturable Actinobacteria from marine sediment of the Todos Santos Bay, Mexico was studied, and bacteria were identified by 16S rRNA gene sequences. The strains were cultured in 1 L of culture media A1 and tested for the effects of seawater on growth. The organic components of cultures were extracted with XAD-7 amberlite and eluted with acetone. The extracts were separated by flash chromatography on C-18 silica gel. The crude extracts and the fractions were tested against colorectal cancer cells HCT-116. In total, twenty six strains were cultured and identified, divided into ten operational taxonomic units (OTUs) with 100% sequence identity, representing 3 families in the order Actinomycetales, belonging to the genus Streptomyces (77%), Micromonospora (20%) and Nocardia (3%); six of those OTUs had not been reported before. Nineteen percent of the crude extracts of the Streptomyces genus showed cytotoxic activity in a range of IC50 of 69.0 to ≤ 0.076 mg·-1. The most active fractions contained compounds identified by their molecular weight and fragmentation patterns as monactin and pamamycin derivatives. Se realizó el estudio de la bioactividad de las Actinobacterias cultivables a partir de sedimento marino de la Bahía de Todos Santos, México, y se identificaron mediante las secuencias del gen 16S ARNr. Las cepas bacterianas fueron cultivadas en 1 L de medio líquido A1 y se constató su crecimiento en presencia de agua de mar. Los extractos orgánicos de los cultivos se extrajeron con Amberlita XAD-7 eluida con acetona. Los extractos fueron separados por cromatografía en gel de sílice C-18. Los extractos crudos y las fracciones se probaron contra células de cáncer de colon HCT-116. En total, 26 cepas fueron cultivadas e identificadas, divididas en 10 unidades taxonómicas operacionales (UTOs) con 100% de identidad de sus secuencias, representando tres familias del orden Actinomycetales, pertenecientes a los géneros Streptomyces (77%), Micromonospora (20%) y Nocardia (3%); 6 de éstos UTOs no habían sido reportados previamente. Diecinueve por ciento de los extractos crudos del género Streptomyces mostraron actividad citotóxica en un rango de IC50 de 69,0 a ≤ 0,076 mg·-1. Las fracciones más activas contenían los compuestos monactin y derivados de pamamicina, los cuales fueron identificados por su peso molecular y sus patrones de fragmentación.