Genetic diversity among common bean (Phaseolus vulgaris L.) Greek landraces and commercial cultivars: nutritional components, RAPD and morphological markers
Se estimó la diversidad genética entre las principales variedades autóctonas y cultivares comerciales de Phaseolus vulgaris L. cultivados en Grecia, mediante el estudio de caracteres morfológicos, agronómicos y fisicoquímicos, junto con el análisis de datos moleculares utilizando marcadores RAPD (am...
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Veröffentlicht in: | Spanish journal of agricultural research : SJAR 2010, Vol.8 (4), p.986-994 |
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Format: | Artikel |
Sprache: | eng |
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container_title | Spanish journal of agricultural research : SJAR |
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creator | Mavromatis, A.G Arvanitoyannis, I.S Korkovelos, A.E Giakountis, A Chatzitheodorou, V.A Goulas, C.K |
description | Se estimó la diversidad genética entre las principales variedades autóctonas y cultivares comerciales de Phaseolus vulgaris L. cultivados en Grecia, mediante el estudio de caracteres morfológicos, agronómicos y fisicoquímicos, junto con el análisis de datos moleculares utilizando marcadores RAPD (amplificación al azar de DNA polimórfico). Se llevó a cabo un análisis cluster (CLA) estimando la similitud con el algoritmo UPGMA, obteniendo un dendrograma que representa las relaciones genéticas entre las principales variedades locales y comerciales de alubia cultivadas en Grecia. Se observó una amplia variación entre variedades locales de alubia en características morfológicas tales como color y tamaño de la semilla y hábitos de crecimiento. En lo que respecta al comportamiento agronómico, se encontraron diferencias significativas en el número y el peso de vainas por planta. También se observó variación en los contenidos de proteína y de grasa. Además, se encontraron valores extremadamente altos de contenido en proteína en algunas variedades como Kastoria y Byzitsa M/M (28,5% y 27,0%, respectivamente), que son mucho mayores que la media registrada previamente para cultivares de esta especie. La semejanza genética estimada mediante el análisis molecular de RAPDs no parece estar relacionada con las características morfológicas de la semilla ni el comportamiento agronómico. Sólo los parámetros cualitativos como el hábito del crecimiento y el origen geográfico de las variedades locales mostraron relación con su clasificación molecular. Las razas locales de alubia se clasificaron en tres subgrupos, mientras que los cultivares comerciales formaron otro grupo separado que refleja una estrecha relación genética entre cultivares.
The genetic diversity among the main local landraces and commercial cultivars of Phaseolus vulgaris L. cultivated in Greece, was estimated by studying the morphological, agronomical and physicochemical traits along with molecular data analysis using random amplified polymorphic DNA (RAPD markers). Cluster analysis was conducted on similarity estimates using the UPGMA algorithm. Application of cluster analysis resulted in a dendrogram representing the genetic relationship among landraces and main bean cultivars grown in Greece. A wide genetic variation was observed among collected local bean landraces in morphological characteristics such as seed color, seed size and growth habit. According to agronomic performance, significant differences were |
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The genetic diversity among the main local landraces and commercial cultivars of Phaseolus vulgaris L. cultivated in Greece, was estimated by studying the morphological, agronomical and physicochemical traits along with molecular data analysis using random amplified polymorphic DNA (RAPD markers). Cluster analysis was conducted on similarity estimates using the UPGMA algorithm. Application of cluster analysis resulted in a dendrogram representing the genetic relationship among landraces and main bean cultivars grown in Greece. A wide genetic variation was observed among collected local bean landraces in morphological characteristics such as seed color, seed size and growth habit. According to agronomic performance, significant differences were found in number and weight of pods per plant. Variation in protein and fat content among landraces and commercial cultivars was also detected. Moreover, in some landraces like Kastoria and Byzitsa M/M extremely high values for protein content (28.6% and 27.0% respectively) were recorded. Such values were greater than the average protein content previously recorded for other cultivars of this species. Genetic similarity estimated from molecular analysis with RAPDs, seemed not to be related with the seed morphological characteristics and agronomic performance. Only qualitative parameters like growth habit and occasionally geographical origin of landraces were positively correlated with the molecular classification. Local bean landraces were classified in three subgroups whereas the commercial cultivars formed another separate group underlining the narrow genetic base of cultivars.</description><identifier>ISSN: 1695-971X</identifier><identifier>ISSN: 2171-9292</identifier><identifier>EISSN: 2171-9292</identifier><identifier>DOI: 10.5424/sjar/2010084-1245</identifier><language>eng</language><publisher>Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)</publisher><subject>agricultura orgánica ; AGRONOMIC CHARACTERS ; alubia seca ; ANATOMIA DE LA PLANTA ; ANATOMIE VEGETALE ; CARACTERE AGRONOMIQUE ; CARACTERISTICAS AGRONOMICAS ; COMPOSICION APROXIMADA ; COMPOSICION DE LOS ALIMENTOS ; COMPOSITION DES ALIMENTS ; COMPOSITION GLOBALE ; dry bean ; FOOD COMPOSITION ; FRIJOL (PHASEOLUS) ; GENETIC MARKERS ; genetic relationships ; GENETIC VARIATION ; GRECE ; GRECIA ; GREECE ; HABITOS DE CRECIMIENTO ; HARICOT COMMUN ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_10961 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_15975 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_210 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_24030 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_32803 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_3373 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_36341 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_4098 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5767 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5954 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5969 ; http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_8157 ; KIDNEY BEANS ; MARCADORES GENETICOS ; MARQUEUR GENETIQUE ; organic farming ; PHASEOLUS VULGARIS ; physicochemical properties ; PLANT ANATOMY ; PLANT HABIT ; PORT DE LA PLANTE ; propiedades fisicoquímicas ; PROXIMATE COMPOSITION ; RAPD ; relaciones genéticas ; VARIACION GENETICA ; VARIATION GENETIQUE ; VARIEDADES ; VARIETE ; VARIETIES</subject><ispartof>Spanish journal of agricultural research : SJAR, 2010, Vol.8 (4), p.986-994</ispartof><rights>LICENCIA DE USO: Los documentos a texto completo incluidos en Dialnet son de acceso libre y propiedad de sus autores y/o editores. Por tanto, cualquier acto de reproducción, distribución, comunicación pública y/o transformación total o parcial requiere el consentimiento expreso y escrito de aquéllos. Cualquier enlace al texto completo de estos documentos deberá hacerse a través de la URL oficial de éstos en Dialnet. Más información: https://dialnet.unirioja.es/info/derechosOAI | INTELLECTUAL PROPERTY RIGHTS STATEMENT: Full text documents hosted by Dialnet are protected by copyright and/or related rights. This digital object is accessible without charge, but its use is subject to the licensing conditions set by its authors or editors. Unless expressly stated otherwise in the licensing conditions, you are free to linking, browsing, printing and making a copy for your own personal purposes. All other acts of reproduction and communication to the public are subject to the licensing conditions expressed by editors and authors and require consent from them. Any link to this document should be made using its official URL in Dialnet. More info: https://dialnet.unirioja.es/info/derechosOAI</rights><lds50>peer_reviewed</lds50><oa>free_for_read</oa><woscitedreferencessubscribed>false</woscitedreferencessubscribed><citedby>FETCH-LOGICAL-c250t-51eb04220532effc464432f4749a52dd5bb1446b1f75b390283230213c9faa5b3</citedby></display><links><openurl>$$Topenurl_article</openurl><openurlfulltext>$$Topenurlfull_article</openurlfulltext><thumbnail>$$Tsyndetics_thumb_exl</thumbnail><link.rule.ids>314,776,780,860,870,27903,27904</link.rule.ids></links><search><creatorcontrib>Mavromatis, A.G</creatorcontrib><creatorcontrib>Arvanitoyannis, I.S</creatorcontrib><creatorcontrib>Korkovelos, A.E</creatorcontrib><creatorcontrib>Giakountis, A</creatorcontrib><creatorcontrib>Chatzitheodorou, V.A</creatorcontrib><creatorcontrib>Goulas, C.K</creatorcontrib><title>Genetic diversity among common bean (Phaseolus vulgaris L.) 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En lo que respecta al comportamiento agronómico, se encontraron diferencias significativas en el número y el peso de vainas por planta. También se observó variación en los contenidos de proteína y de grasa. Además, se encontraron valores extremadamente altos de contenido en proteína en algunas variedades como Kastoria y Byzitsa M/M (28,5% y 27,0%, respectivamente), que son mucho mayores que la media registrada previamente para cultivares de esta especie. La semejanza genética estimada mediante el análisis molecular de RAPDs no parece estar relacionada con las características morfológicas de la semilla ni el comportamiento agronómico. Sólo los parámetros cualitativos como el hábito del crecimiento y el origen geográfico de las variedades locales mostraron relación con su clasificación molecular. Las razas locales de alubia se clasificaron en tres subgrupos, mientras que los cultivares comerciales formaron otro grupo separado que refleja una estrecha relación genética entre cultivares.
The genetic diversity among the main local landraces and commercial cultivars of Phaseolus vulgaris L. cultivated in Greece, was estimated by studying the morphological, agronomical and physicochemical traits along with molecular data analysis using random amplified polymorphic DNA (RAPD markers). Cluster analysis was conducted on similarity estimates using the UPGMA algorithm. Application of cluster analysis resulted in a dendrogram representing the genetic relationship among landraces and main bean cultivars grown in Greece. A wide genetic variation was observed among collected local bean landraces in morphological characteristics such as seed color, seed size and growth habit. According to agronomic performance, significant differences were found in number and weight of pods per plant. Variation in protein and fat content among landraces and commercial cultivars was also detected. Moreover, in some landraces like Kastoria and Byzitsa M/M extremely high values for protein content (28.6% and 27.0% respectively) were recorded. Such values were greater than the average protein content previously recorded for other cultivars of this species. Genetic similarity estimated from molecular analysis with RAPDs, seemed not to be related with the seed morphological characteristics and agronomic performance. Only qualitative parameters like growth habit and occasionally geographical origin of landraces were positively correlated with the molecular classification. 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Se observó una amplia variación entre variedades locales de alubia en características morfológicas tales como color y tamaño de la semilla y hábitos de crecimiento. En lo que respecta al comportamiento agronómico, se encontraron diferencias significativas en el número y el peso de vainas por planta. También se observó variación en los contenidos de proteína y de grasa. Además, se encontraron valores extremadamente altos de contenido en proteína en algunas variedades como Kastoria y Byzitsa M/M (28,5% y 27,0%, respectivamente), que son mucho mayores que la media registrada previamente para cultivares de esta especie. La semejanza genética estimada mediante el análisis molecular de RAPDs no parece estar relacionada con las características morfológicas de la semilla ni el comportamiento agronómico. Sólo los parámetros cualitativos como el hábito del crecimiento y el origen geográfico de las variedades locales mostraron relación con su clasificación molecular. Las razas locales de alubia se clasificaron en tres subgrupos, mientras que los cultivares comerciales formaron otro grupo separado que refleja una estrecha relación genética entre cultivares.
The genetic diversity among the main local landraces and commercial cultivars of Phaseolus vulgaris L. cultivated in Greece, was estimated by studying the morphological, agronomical and physicochemical traits along with molecular data analysis using random amplified polymorphic DNA (RAPD markers). Cluster analysis was conducted on similarity estimates using the UPGMA algorithm. Application of cluster analysis resulted in a dendrogram representing the genetic relationship among landraces and main bean cultivars grown in Greece. A wide genetic variation was observed among collected local bean landraces in morphological characteristics such as seed color, seed size and growth habit. According to agronomic performance, significant differences were found in number and weight of pods per plant. Variation in protein and fat content among landraces and commercial cultivars was also detected. Moreover, in some landraces like Kastoria and Byzitsa M/M extremely high values for protein content (28.6% and 27.0% respectively) were recorded. Such values were greater than the average protein content previously recorded for other cultivars of this species. Genetic similarity estimated from molecular analysis with RAPDs, seemed not to be related with the seed morphological characteristics and agronomic performance. Only qualitative parameters like growth habit and occasionally geographical origin of landraces were positively correlated with the molecular classification. Local bean landraces were classified in three subgroups whereas the commercial cultivars formed another separate group underlining the narrow genetic base of cultivars.</abstract><pub>Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria (INIA)</pub><doi>10.5424/sjar/2010084-1245</doi><tpages>9</tpages><oa>free_for_read</oa></addata></record> |
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subjects | agricultura orgánica AGRONOMIC CHARACTERS alubia seca ANATOMIA DE LA PLANTA ANATOMIE VEGETALE CARACTERE AGRONOMIQUE CARACTERISTICAS AGRONOMICAS COMPOSICION APROXIMADA COMPOSICION DE LOS ALIMENTOS COMPOSITION DES ALIMENTS COMPOSITION GLOBALE dry bean FOOD COMPOSITION FRIJOL (PHASEOLUS) GENETIC MARKERS genetic relationships GENETIC VARIATION GRECE GRECIA GREECE HABITOS DE CRECIMIENTO HARICOT COMMUN http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_10961 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_15975 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_210 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_24030 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_32803 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_3373 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_36341 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_4098 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5767 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5954 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_5969 http://www.fao.org/aos/agrovoc#c_8157 KIDNEY BEANS MARCADORES GENETICOS MARQUEUR GENETIQUE organic farming PHASEOLUS VULGARIS physicochemical properties PLANT ANATOMY PLANT HABIT PORT DE LA PLANTE propiedades fisicoquímicas PROXIMATE COMPOSITION RAPD relaciones genéticas VARIACION GENETICA VARIATION GENETIQUE VARIEDADES VARIETE VARIETIES |
title | Genetic diversity among common bean (Phaseolus vulgaris L.) Greek landraces and commercial cultivars: nutritional components, RAPD and morphological markers |
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