节杆菌A3分裂蛋白FtsQ基因克隆及其功能预测

节杆菌A3分裂蛋白FtsQ基因克隆及其功能预测

利用TAIL—PCR（Thermal Asymmetric Interlaced PCR）方法克隆节杆菌A3ftsq基因序列，基于生物信息学软件分别进行fisq序列同源性分析、蛋白质FtsQ跨膜域及三级结构预测，初步预测该基因所编码蛋白FtsQ的功能．结果表明：节杆菌A3flsq基因全序列1035bp，编码氨基酸344个；节杆菌A3 ftsq基因与谷氨酸棒状杆菌、结核分枝杆菌和天蓝色链霉菌ftsq亲缘关系比较近，与大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、新月柄杆菌和肺炎链球菌亲缘关系比较远；节杆菌蛋白质FtsQ为一次跨膜蛋白，包括膜内域（1—114氨基酸残基）、跨膜域（115—139氨基酸残基）和膜外域（14...

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Veröffentlicht in:冰川冻土 2014, Vol.36 (2), p.451-456
1. Verfasser: 袁杰 周建业 吾斯曼江·艾尔肯 李志强 何祥一
Format: Artikel
Sprache:chi
Schlagworte:
功能预测
基因克隆
节杆菌A3
蛋白FtsQ
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creator 袁杰 周建业 吾斯曼江·艾尔肯 李志强 何祥一
description 利用TAIL—PCR（Thermal Asymmetric Interlaced PCR）方法克隆节杆菌A3ftsq基因序列，基于生物信息学软件分别进行fisq序列同源性分析、蛋白质FtsQ跨膜域及三级结构预测，初步预测该基因所编码蛋白FtsQ的功能．结果表明：节杆菌A3flsq基因全序列1035bp，编码氨基酸344个；节杆菌A3 ftsq基因与谷氨酸棒状杆菌、结核分枝杆菌和天蓝色链霉菌ftsq亲缘关系比较近，与大肠杆菌、枯草芽孢杆菌、新月柄杆菌和肺炎链球菌亲缘关系比较远；节杆菌蛋白质FtsQ为一次跨膜蛋白，包括膜内域（1—114氨基酸残基）、跨膜域（115—139氨基酸残基）和膜外域（140—344氨基酸残基）；空间结构预测节杆菌FtsQ膜内域和跨膜域空间结构缺失．因此，节杆菌A3FtsQ蛋白与大肠杆菌、枯草芽孢杆菌FtsQ膜内域在长度和空间结构存在显著不同，其膜内域较长，较长的膜内域段可能取代了缺失的FtsA的功能，辅助z环的锚定和下游蛋白的吸附．当节杆菌A3处于电离、辐射、寒冷等极端环境时，ftsq或许是节杆菌生存的必须基因；当节杆菌处于实验条件温度为20℃，营养充足，flsq则可能是非必须基因．节杆菌A3FtsQ在细菌细胞分裂时可能通过与上游蛋白、下游蛋白相互作用，确定细胞分裂位点和速度；同时FtsQ参与合成肽聚糖，一方面，促使细胞内陷皱缩，细胞一分为二；另一方面，FtsQ合成厚厚的细胞壁以适应极端环境的需要．
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