Diversité et rôle des champignons ectomycorhiziens dans l’adaptation de Coccoloba uvifera (L.) L à la salinité : application à la restauration écologique à Cuba

À Cuba (Grandes Antilles), Coccoloba uvifera (L.) L. (Polygonacée), arbre fruitier ectomycorhizien (ECM), communément appelé raisinier bord de mer, pousse sur des sols sableux et salés en bordure du littoral. Le raisinier bord de mer serait un bon candidat pour la restauration des écosystèmes côtiers dégradés à Cuba. Les objectifs de cette thèse étaient (i) d’étudier la variabilité morphologique et physiologique des fruits, graines et jeunes plants de différentes provenances de C. uvifera, (ii) de déterminer les communautés de champignons ECMs associées aux arbres adultes et jeunes plants de C. uvifera, (iii) d’évaluer la tolérance au sel de C. uvifera associée au champignon ECM Scleroderma bermudense en conditions contrôlées, (iv) d’évaluer la capacité de C. uvifera et de son symbiote S. bermudense à restaurer un écosystème côtier dégradé à Cuba.Des paramètres morphologiques (poids, diamètre et longueur des fruits, graines et jeunes plants, surface foliaire) et physiologiques (teneur en eau et en chlorophylle, fluorescence de la chlorophylle) ont montré une variabilité des fruits, des graines et des jeunes plants de différentes provenances de C. uvifera.Au total, 5 espèces fongiques ECMs (S. bermudense, Russula sp., Cantharellus sp., Inocybe sp. et Amanita sp.) ont été identifiés à partir des sporophores récoltés à proximité de C. uvifera dans trois sites côtiers. Le séquençage de l’ITS (spaceur interne transcrit) d’ectomycorhizes (EMe) d’arbres adultes et de jeunes plants de C. uvifera a permis d’identifier 6 taxons fongiques ECM (S. bermudense, deux Tuber spp., Tomentella sp., Inocybe sp., et Thelephora sp.) et seul le taxon fongique S. bermudense a été identifié (similarité 99%-100%) parmi les sporophores. Scleroderma bermudense a été le champignon le plus représenté en termes de sporophores et d’EMe récoltés. Les arbres adultes et les jeunes plants ont partagé 50% des communautés fongiques qui formeraient des réseaux ECM communs potentiels.En conditions contrôlées, S. bermudense a amélioré la tolérance au sel de deux provenances de C. uvifera en diminuant les concentrations de Na et en augmentant celles de K et de Ca favorisant ainsi un rapport K/Na et Ca/Na plus élevé dans les tissus des plants inoculés. Il a également été démontré les effets bénéfiques de la symbiose ectomycorhizienne sur la croissance, la photosynthèse, la transpiration, la teneur en chlorophylle, la fluorescence de la chlorophylle, la conductance stomatique, le CO2 intercellulaire