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SMOG 2: A Versatile Software Package for Generating Structure-Based Models
Veröffentlicht in PLoS computational biology
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How EF-Tu can contribute to efficient proofreading of aa-tRNA by the ribosome
Veröffentlicht in Nature communications
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Studying ribosome dynamics with simplified models
Veröffentlicht in Methods (San Diego, Calif.)
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SMOG@ctbp: simplified deployment of structure-based models in GROMACS
Veröffentlicht in Nucleic acids research
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Anisotropic Fluctuations in the Ribosome Determine tRNA Kinetics
Veröffentlicht in The journal of physical chemistry. B
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Generalized Manning Condensation Model Captures the RNA Ion Atmosphere
Veröffentlicht in Physical review letters
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SMOG 2 and OpenSMOG: Extending the limits of structure‐based models
Veröffentlicht in Protein science
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Anisotropic Fluctuations in the Ribosome Determine aa-tRNA Kinetics
Veröffentlicht in Biophysical journal
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Using SMOG 2 to Simulate Complex Biomolecular Assemblies
Veröffentlicht in Biomolecular Simulations
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Reduced Model Captures Mg2+-RNA Interaction Free Energy of Riboswitches
Veröffentlicht in Biophysical journal
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Reduced model captures Mg(2+)-RNA interaction free energy of riboswitches
Veröffentlicht in Biophysical journal
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