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Workflow enabling deepscale immunopeptidome, proteome, ubiquitylome, phosphoproteome, and acetylome analyses of sample-limited tissues
von
Abelin, Jennifer G.
,
Bergstrom, Erik J.
,
Rivera, Keith D.
,
Taylor, Hannah B.
,
Klaeger, Susan
,
Xu, Charles
,
Verzani, Eva K.
,
Jackson White, C.
,
Woldemichael, Hilina B.
,
Virshup, Maya
,
Olive, Meagan E.
,
Maynard, Myranda
,
Vartany, Stephanie A.
,
Allen, Joseph D.
,
Phulphagar, Kshiti
,
Harry Kane, M.
,
Rachimi, Suzanna
,
Mani, D. R.
,
Gillette, Michael A.
,
Satpathy, Shankha
,
Clauser, Karl R.
,
Udeshi, Namrata D.
,
Carr, Steven A.
Veröffentlicht in
Nature communications
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2
Sensitive, High-Throughput HLA-I and HLA-II Immunopeptidomics Using Parallel Accumulation-Serial Fragmentation Mass Spectrometry
von
Phulphagar, Kshiti Meera
,
Ctortecka, Claudia
,
Jacome, Alvaro Sebastian Vaca
,
Klaeger, Susan
,
Verzani, Eva K.
,
Hernandez, Gabrielle M.
,
Udeshi, Namrata D.
,
Clauser, Karl R.
,
Abelin, Jennifer G.
,
Carr, Steven A.
Veröffentlicht in
Molecular & cellular proteomics
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3
Targeting the aminopeptidase ERAP enhances antitumor immunity by disrupting the NKG2A-HLA-E inhibitory checkpoint
von
Tsao, Hsiao-Wei
,
Anderson, Seth
,
Finn, Kenneth J.
,
Perera, Jonathan J.
,
Pass, Lomax F.
,
Schneider, Emily M.
,
Jiang, Aiping
,
Fetterman, Rachel
,
Chuong, Cun Lan
,
Kozuma, Kaiya
,
Stickler, Marcia M.
,
Creixell, Marc
,
Klaeger, Susan
,
Phulphagar, Kshiti Meera
,
Rachimi, Suzanna
,
Verzani, Eva K.
,
Olsson, Niclas
,
Dubrot, Juan
,
Pech, Matthew F.
,
Silkworth, Whitney
,
Lane-Reticker, Sarah Kate
,
Allen, Peter M.
,
Ibrahim, Kyrellos
,
Knudsen, Nelson H.
,
Cheng, Andrew Y.
,
Long, Adrienne H.
,
Ebrahimi-Nik, Hakimeh
,
Kim, Sarah Y.
,
Du, Peter P.
,
Iracheta-Vellve, Arvin
,
Robitschek, Emily J.
,
Suermondt, Juliette S.M.T.
,
Davis, Thomas G.R.
,
Wolfe, Clara H.
,
Atluri, Trisha
,
Olander, Kira E.
,
Rush, Jason S.
,
Sundberg, Thomas B.
,
McAllister, Fiona E.
,
Abelin, Jennifer G.
,
Firestone, Ari
,
Stokoe, David
,
Carr, Steven A.
,
Harding, Fiona A.
,
Yates, Kathleen B.
,
Manguso, Robert T.
Veröffentlicht in
Immunity (Cambridge, Mass.)
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4
1040-B Identifying tumor-associated antigens in different stages of multiple myeloma using low input HLA immunopeptidomics
von
Hernandez, Gabrielle M
,
Taylor, Hannah
,
Verzani, Eva K
,
Ctortecka, Claudia
,
Berrios Nolasco, David A
,
Clauser, Karl R
,
Udeshi, Namrata D
,
Abelin, Jennifer G
,
Manasanch, Elisabet
,
Carr, Steven A
Veröffentlicht in
Journal for immunotherapy of cancer
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Artikel
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5
1408 Non-canonical peptide sources broaden the landscape of targetable antigens in pancreatic cancer
von
Ely, Zackery A
,
Kulstad, Zachary J
,
Abelin, Jennifer G
,
Verzani, Eva K
,
Addepalli, Sudarsana
,
Clauser, Karl
,
Kapner, Kevin S
,
Hennessey, Connor J
,
Agus, Miles
,
Klaeger, Susan
,
Jaeger, Alex M
,
Su, Jennifer
,
Greenberg, Philip D
,
Aguirre, Andrew J
,
Carr, Steven
,
Jacks, Tyler
,
Freed-Pastor, William
Veröffentlicht in
Journal for immunotherapy of cancer
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Artikel
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6
Abstract 2369: Discovering and assessing novel epitopes of Bordetella pertussis to improve the whooping cough vaccine through immunopeptidome analysis and immune recognition assays
von
Hernandez, Gabrielle
,
Shamseldin, Mohamed
,
Verzani, Eva
,
Clauser, Karl
,
Hall, Jesse
,
Carr, Steven
,
Abelin, Jennifer
,
Dubey, Purnima
Veröffentlicht in
The Journal of biological chemistry
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7
Development of a next generation pertussis vaccine: An unbiased biochemical approach to identify novel CD4+ T cell recognized antigens from Bordetella pertussis
von
Shamseldin, Mohamed Medhat
,
Hernandez, Gabrielle
,
Verzani, Eva
,
Hall, Jesse M
,
Caution, Kyle J
,
Carr, Steven A
,
Deora, Rajendar
,
Abbelin, Jenn
,
Dubey, Purnima
Veröffentlicht in
The Journal of immunology (1950)
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Artikel
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8
Abstract C014: Broadening the repertoire of PDAC-specific targets for immune-based therapy through high-resolution immunopeptidomics
von
Ely, Zackery A.
,
Freed-Pastor, William A.
,
Kulstad, Zachary J.
,
Abelin, Jennifer G.
,
Verzani, Eva
,
Kapner, Kevin S.
,
Klaeger, Susan
,
Clauser, Karl R.
,
Agus, Miles
,
Jaeger, Alex M.
,
Pattada, Nimisha B.
,
Bhutkar, Arjun
,
Aguirre, Andrew J.
,
Carr, Steven A.
,
Jacks, Tyler
Veröffentlicht in
Cancer research (Chicago, Ill.)
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9
Abstract A038: Non-canonical MHC class I-associated antigens in pancreatic cancer
von
Ely, Zackery A.
,
Kulstad, Zachary J.
,
Verzani, Eva K.
,
Abelin, Jennifer G.
,
Addepalli, Sudarsana
,
Clauser, Karl R.
,
Casarrubios, Marta
,
Kapner, Kevin S.
,
Agus, Miles P.
,
Hennessey, Connor J.
,
Hadrup, Sine R.
,
Klaeger, Susan
,
Su, Jennifer
,
Jaeger, Alex M.
,
Wolpin, Brian M.
,
Raghavan, Srivatsan
,
Greenberg, Philip D.
,
Aguirre, Andrew J.
,
Carr, Steven A.
,
Jacks, Tyler
,
Freed-Pastor, William A.
Veröffentlicht in
Cancer research (Chicago, Ill.)
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