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Crohn Disease Risk Prediction-Best Practices and Pitfalls with Exome Data
von
Giollo, M
,
Jones, DT
,
Carraro, M
,
Leonardi, E
,
Ferrari, C
,
Tosatto, SC
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InterPro in 2017-beyond protein family and domain annotations
von
Finn, RD
,
Attwood, TK
,
Babbitt, PC
,
Bateman, A
,
Bork, P
,
Bridge, AJ
,
Chang, HY
,
Dosztányi, Z
,
El-Gebali, S
,
Fraser, M
,
Gough, J
,
Haft, D
,
Holliday, GL
,
Huang, H
,
Huang, X
,
Letunic, I
,
Lopez, R
,
Lu, S
,
Marchler-Bauer, A
,
Mi, H
,
Mistry, J
,
Natale, DA
,
Necci, M
,
Nuka, G
,
Orengo, CA
,
Park, Y
,
Pesseat, S
,
Piovesan, D
,
Potter, SC
,
Rawlings, ND
,
Redaschi, N
,
Richardson, L
,
Rivoire, C
,
Sangrador-Vegas, A
,
Sigrist, C
,
Sillitoe, I
,
Smithers, B
,
Squizzato, S
,
Sutton, G
,
Thanki, N
,
Thomas, PD
,
Tosatto, SC
,
Wu, CH
,
Xenarios, I
,
Yeh, LS
,
Young, SY
,
Mitchell, AL
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3
An expanded evaluation of protein function prediction methods shows an improvement in accuracy
von
Jiang, Y
,
Oron, TR
,
Clark, WT
,
Bankapur, AR
,
D'Andrea, D
,
Lepore, R
,
Funk, CS
,
Kahanda, I
,
Verspoor, KM
,
Ben-Hur, A
,
Koo, DACE
,
Penfold-Brown, D
,
Youngs, N
,
Bonneau, R
,
Lin, A
,
Sahraeian, SM
,
Martelli, PL
,
Profiti, G
,
Casadio, R
,
Cao, R
,
Zhong, Z
,
Cheng, J
,
Skunca, N
,
Dogan, T
,
Hakala, K
,
Mehryary, F
,
Ginter, F
,
Fang, H
,
Smithers, B
,
Gough, J
,
Koskinen, P
,
Chen, CT
,
Hsu, WL
,
Cozzetto, D
,
Minneci, F
,
Jones, DT
,
Bkc, D
,
Khan, IK
,
Kihara, D
,
Ofer, D
,
Rappoport, N
,
Stern, A
,
Denny, P
,
Foulger, RE
,
Legge, D
,
Magrane, M
,
Melidoni, AN
,
Pichler, K
,
Shypitsyna, A
,
Li, B
,
ElShal, S
,
Tranchevent, LC
,
Dawson, NL
,
Sillitoe, I
,
Bhat, P
,
Nepusz, T
,
Paccanaro, A
,
Sedeño-Cortés, AE
,
Pavlidis, P
,
Feng, S
,
Cejuela, JM
,
Goldberg, T
,
Richter, L
,
Gabaldon, T
,
Supek, F
,
Gong, Q
,
Ning, W
,
Tian, W
,
Fontana, P
,
Toppo, S
,
Ferrari, C
,
Giollo, M
,
Piovesan, D
,
Del Pozo, A
,
Benso, A
,
Politano, G
,
Savino, A
,
Rehman, HU
,
Valentini, G
,
Bargsten, JW
,
van Dijk, AD
,
Gemovic, B
,
Perovic, V
,
Sharan, M
,
Vogel, J
,
Kansakar, L
,
Zhang, S
,
Vucetic, S
,
Wang, Z
,
Sternberg, MJ
,
Huntley, RP
,
Martin, MJ
,
O'Donovan, C
,
Robinson, PN
,
Moreau, Y
,
Linial, M
,
Orengo, CA
,
Rost, B
,
Greene, CS
,
Radivojac, P
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4
InterPro in 2019: improving coverage, classification and access to protein sequence annotations
von
Mitchell, AL
,
Attwood, TK
,
Babbitt, PC
,
Blum, M
,
Bork, P
,
Bridge, A
,
Brown, SD
,
Chang, H-Y
,
El-Gebali, S
,
Fraser, MI
,
Gough, J
,
Haft, DR
,
Huang, H
,
Letunic, I
,
Lopez, R
,
Luciani, A
,
Madeira, F
,
Marchler-Bauer, A
,
Mi, H
,
Natale, DA
,
Necci, M
,
Nuka, G
,
Orengo, C
,
Pandurangan, AP
,
Paysan-Lafosse, T
,
Pesseat, S
,
Potter, SC
,
Qureshi, MA
,
Rawlings, ND
,
Redaschi, N
,
Richardson, LJ
,
Rivoire, C
,
Salazar, GA
,
Sangrador-Vegas, A
,
Sigrist, CJA
,
Sillitoe, I
,
Sutton, GG
,
Thanki, N
,
Thomas, PD
,
Tosatto, SCE
,
Yong, S-Y
,
Finn, RD
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Crohn Disease
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Protein Function Prediction
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Variants Prioritization
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