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Efficient alignment of pyrosequencing reads for re-sequencing applications
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Small Longest Tandem Scattered Subsequences
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Cache-Oblivious parallel SIMD Viterbi decoding for sequence search in HMMER
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A compressed self-index using a Ziv–Lempel dictionary
Veröffentlicht in Information retrieval (Boston)
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SOFIA: Selection of Medical Features by Induced Alterations in Numeric Labels
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More Time-Space Tradeoffs for Finding a Shortest Unique Substring
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Range minimum queries in minimal space
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Searching for a Feedback Vertex Set with the link-cut tree
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Order-preserving pattern matching indeterminate strings
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