PlasmidSeeker: identification of known plasmids from bacterial whole genome sequencing reads von Roosaare, Märt, Puustusmaa, Mikk, Möls, Märt, Vaher, Mihkel, Remm, Maido

Volltext

Microbial population dynamics in response to Pectobacterium atrosepticum infection in potato tubers von Kõiv, Viia, Roosaare, Märt, Vedler, Eve, Ann Kivistik, Paula, Toppi, Kristel, Schryer, David W., Remm, Maido, Tenson, Tanel, Mäe, Andres

Volltext

Endophytic bacterial communities in peels and pulp of five root vegetables von Kõiv, Viia, Arbo, Krõõt, Maiväli, Ülo, Kisand, Veljo, Roosaare, Märt, Remm, Maido, Tenson, Tanel

Volltext

StrainSeeker: fast identification of bacterial strains from raw sequencing reads using user-provided guide trees von Roosaare, Märt, Vaher, Mihkel, Kaplinski, Lauris, Möls, Märt, Andreson, Reidar, Lepamets, Maarja, Kõressaar, Triinu, Naaber, Paul, Kõljalg, Siiri, Remm, Maido

Volltext

PlasmidSeeker database k=20 von Roosaare, Märt

Volltext bestellen

PlasmidSeeker database k=16 von Roosaare, Märt

Volltext bestellen

StrainSeeker database k=32 von Roosaare, Märt

Volltext bestellen

Strainseeker database k=16 von Roosaare, Märt

Volltext bestellen