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Reconciled rat and human metabolic networks for comparative toxicogenomics and biomarker predictions
von
Blais, Edik M.
,
Rawls, Kristopher D.
,
Dougherty, Bonnie V.
,
Li, Zhuo I.
,
Kolling, Glynis L.
,
Ye, Ping
,
Wallqvist, Anders
,
Papin, Jason A.
Veröffentlicht in
Nature communications
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2
Identifying metabolic adaptations characteristic of cardiotoxicity using paired transcriptomics and metabolomics data integrated with a computational model of heart metabolism
von
Dougherty, Bonnie V
,
Moore, Connor J
,
Rawls, Kristopher D
,
Jenior, Matthew L
,
Chun, Bryan
,
Nagdas, Sarbajeet
,
Saucerman, Jeffrey J
,
Kolling, Glynis L
,
Wallqvist, Anders
,
Papin, Jason A
Veröffentlicht in
PLoS computational biology
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3
Identifying functional metabolic shifts in heart failure with the integration of omics data and a heart-specific, genome-scale model
von
Dougherty, Bonnie V.
,
Rawls, Kristopher D.
,
Kolling, Glynis L.
,
Vinnakota, Kalyan C.
,
Wallqvist, Anders
,
Papin, Jason A.
Veröffentlicht in
Cell reports (Cambridge)
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4
Validation of a multicellular tumor microenvironment system for modeling patient tumor biology and drug response
von
Roller, Devin G.
,
Hoang, Stephen A.
,
Rawls, Kristopher D.
,
Owen, Katherine A.
,
Simmers, Michael B.
,
Figler, Robert A.
,
Wulfkuhle, Julia D.
,
Petricoin, Emanuel F.
,
Wamhoff, Brian R.
,
Gioeli, Daniel
Veröffentlicht in
Scientific reports
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5
Predicting changes in renal metabolism after compound exposure with a genome-scale metabolic model
von
Rawls, Kristopher D.
,
Dougherty, Bonnie V.
,
Vinnakota, Kalyan C.
,
Pannala, Venkat R.
,
Wallqvist, Anders
,
Kolling, Glynis L.
,
Papin, Jason A.
Veröffentlicht in
Toxicology and applied pharmacology
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6
Mechanistic identification of biofluid metabolite changes as markers of acetaminophen-induced liver toxicity in rats
von
Pannala, Venkat R.
,
Vinnakota, Kalyan C.
,
Rawls, Kristopher D.
,
Estes, Shanea K.
,
O'Brien, Tracy P.
,
Printz, Richard L.
,
Papin, Jason A.
,
Reifman, Jaques
,
Shiota, Masakazu
,
Young, Jamey D.
,
Wallqvist, Anders
Veröffentlicht in
Toxicology and applied pharmacology
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7
Genome-Scale Characterization of Toxicity-Induced Metabolic Alterations in Primary Hepatocytes
von
Rawls, Kristopher D
,
Blais, Edik M
,
Dougherty, Bonnie V
,
Vinnakota, Kalyan C
,
Pannala, Venkat R
,
Wallqvist, Anders
,
Kolling, Glynis L
,
Papin, Jason A
Veröffentlicht in
Toxicological sciences
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8
A simplified metabolic network reconstruction to promote understanding and development of flux balance analysis tools
von
Rawls, Kristopher D.
,
Dougherty, Bonnie V.
,
Blais, Edik M.
,
Stancliffe, Ethan
,
Kolling, Glynis L.
,
Vinnakota, Kalyan
,
Pannala, Venkat R.
,
Wallqvist, Anders
,
Papin, Jason A.
Veröffentlicht in
Computers in biology and medicine
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9
Reconciled Rat and Human Metabolic Networks for Comparative Toxicogenomics and Biomarker Predictions
von
Blais,Edik M
,
Rawls,Kristopher D
,
Dougherty,Bonnie V
,
Li,Zhuo I
,
Kolling,Glynis L
,
Ye,Ping
,
Wallqvist,Anders
,
Papin,Jason A
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10
Metabolic Network Reconstructions to Predict Drug Targets and Off-Target Effects
von
Rawls, Kristopher
,
Dougherty, Bonnie V.
,
Papin, Jason
Veröffentlicht in
Metabolic Flux Analysis in Eukaryotic Cells
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