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Setting up a large set of protein-ligand PDB complexes for the development and validation of knowledge-based docking algorithms
von
Diago, Luis A
,
Morell, Persy
,
Aguilera, Longendri
,
Moreno, Ernesto
Veröffentlicht in
BMC bioinformatics
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Results from the docking simulations performed for 542 complexes from the PDB2005 dataset, using three different sets of chemical matching rules
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,
Persy Morell
,
Longendri Aguilera
,
Moreno, Ernesto
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Examples of molecules that were correctly protonated by the modified Babel program
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,
Persy Morell
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Longendri Aguilera
,
Moreno, Ernesto
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Distribution of probable (F) and very probable (VF) protein-ligand complexes, given in percent relative to the number of matching pairs
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,
Persy Morell
,
Longendri Aguilera
,
Moreno, Ernesto
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Examples of statistical data extracted from the database
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,
Longendri Aguilera
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Moreno, Ernesto
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Relationships between different variables in the database
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Diago, Luis A
,
Persy Morell
,
Longendri Aguilera
,
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Implementation of the database in a SQL Server
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