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QM/MM Study of the Reaction Catalyzed by Alkyladenine DNA Glycosylase: Examination of the Substrate Specificity of a DNA Repair Enzyme
von
Lenz, Stefan A. P
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
The journal of physical chemistry. B
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Hydrolytic Glycosidic Bond Cleavage in RNA Nucleosides: Effects of the 2′-Hydroxy Group and Acid–Base Catalysis
von
Lenz, Stefan A. P
,
Kohout, Johnathan D
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
The journal of physical chemistry. B
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3
DNA repair enzymes ALKBH2, ALKBH3, and AlkB oxidize 5-methylcytosine to 5-hydroxymethylcytosine, 5-formylcytosine and 5-carboxylcytosine in vitro
von
Bian, Ke
,
Lenz, Stefan A P
,
Tang, Qi
,
Chen, Fangyi
,
Qi, Rui
,
Jost, Marco
,
Drennan, Catherine L
,
Essigmann, John M
,
Wetmore, Stacey D
,
Li, Deyu
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Nucleic acids research
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4
Insights into the Direct Oxidative Repair of Etheno Lesions: MD and QM/MM Study on the Substrate Scope of ALKBH2 and AlkB
von
Lenz, Stefan A.P.
,
Li, Deyu
,
Wetmore, Stacey D.
Veröffentlicht in
DNA repair
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5
DFT Study on the Deglycosylation of Methylated, Oxidized, and Canonical Pyrimidine Nucleosides in Water: Implications for Epigenetic Regulation and DNA Repair
von
Jeong, Ye Eun Rebecca
,
Lenz, Stefan A. P
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
The journal of physical chemistry. B
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6
Evaluating the Substrate Selectivity of Alkyladenine DNA Glycosylase: The Synergistic Interplay of Active Site Flexibility and Water Reorganization
von
Lenz, Stefan A. P
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
Biochemistry (Easton)
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7
Quantum Chemical Studies of the Structure and Stability of N‑Methylated DNA Nucleobase Dimers: Insights into the Mutagenic Base Pairing of Damaged DNA
von
Felske, Lindey R
,
Lenz, Stefan A. P
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
The journal of physical chemistry. A, Molecules, spectroscopy, kinetics, environment, & general theory
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8
Glycosidic Bond Cleavage in DNA Nucleosides: Effect of Nucleobase Damage and Activation on the Mechanism and Barrier
von
Lenz, Stefan A. P
,
Kellie, Jennifer L
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
The journal of physical chemistry. B
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9
Structural explanation for the tunable substrate specificity of an E. coli nucleoside hydrolase: insights from molecular dynamics simulations
von
Lenz, Stefan A. P.
,
Wetmore, Stacey D.
Veröffentlicht in
Journal of computer-aided molecular design
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10
Glycosidic Bond Cleavage in Deoxynucleotides: Effects of Solvent and the DNA Phosphate Backbone in the Computational Model
von
Lenz, Stefan A. P
,
Kellie, Jennifer L
,
Wetmore, Stacey D
Veröffentlicht in
The journal of physical chemistry. B
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11
Hydrolysis of the damaged deoxythymidine glycol nucleoside and comparison to canonical DNA
von
NAVARRO-WHYTE, Lex
,
KELLIE, Jennifer L
,
LENZ, Stefan A. P
,
WETMORE, Stacey D
Veröffentlicht in
Physical chemistry chemical physics : PCCP
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