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Evaluation of high molecular weight DNA extraction methods for long-read sequencing of Shiga toxin-producing Escherichia coli
von
Jaudou, Sandra
,
Tran, Mai-Lan
,
Vorimore, Fabien
,
Fach, Patrick
,
Delannoy, Sabine
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PloS one
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Combination of whole genome sequencing and supervised machine learning provides unambiguous identification of eae -positive Shiga toxin-producing Escherichia coli
von
Vorimore, Fabien
,
Jaudou, Sandra
,
Tran, Mai-Lan
,
Richard, Hugues
,
Fach, Patrick
,
Delannoy, Sabine
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Frontiers in microbiology
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Exploring Long-Read Metagenomics for Full Characterization of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli in Presence of Commensal E. coli
von
Jaudou, Sandra
,
Deneke, Carlus
,
Tran, Mai-Lan
,
Salzinger, Carina
,
Vorimore, Fabien
,
Goehler, André
,
Schuh, Elisabeth
,
Malorny, Burkhard
,
Fach, Patrick
,
Grützke, Josephine
,
Delannoy, Sabine
Veröffentlicht in
Microorganisms (Basel)
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Hybrid Assembly from 75 E. coli Genomes Isolated from French Bovine Food Products between 1995 and 2016
von
Jaudou, Sandra
,
Tran, Mai-Lan
,
Vorimore, Fabien
,
Fach, Patrick
,
Delannoy, Sabine
Veröffentlicht in
Microbiology resource announcements
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Metadetect : detection of Shiga toxin-producing Escherichia coli with novel metagenomics approaches and its application on dairy farms in France and Germany
von
Jaudou, Sandra
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6
Evaluation of high molecular weight DNA extraction methods for long-read sequencing of Shiga toxin-producing Escherichia coli
von
Sandra Jaudou
,
Mai-Lan Tran
,
Fabien Vorimore
,
Patrick Fach
,
Sabine Delannoy
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PloS one
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A step forward for Shiga toxin-producing Escherichia coli identification and characterization in raw milk using long-read metagenomics
von
Jaudou, Sandra
,
Deneke, Carlus
,
Tran, Mai-Lan
,
Schuh, Elisabeth
,
Goehler, André
,
Vorimore, Fabien
,
Malorny, Burkhard
,
Fach, Patrick
,
Grützke, Josephine
,
Delannoy, Sabine
Veröffentlicht in
Microbial genomics
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Exploring Long-Read Metagenomics for Full Characterization of Shiga Toxin-Producing IEscherichia coli/I in Presence of Commensal IE. coli/I
von
Jaudou, Sandra
,
Deneke, Carlus
,
Tran, Mai-Lan
,
Salzinger, Carina
,
Vorimore, Fabien
,
Goehler, André
,
Schuh, Elisabeth
,
Malorny, Burkhard
,
Fach, Patrick
,
Grützke, Josephine
,
Delannoy, Sabine
Veröffentlicht in
Microorganisms (Basel)
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