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CoRegNet: reconstruction and integrated analysis of co-regulatory networks
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Latent network-based representations for large-scale gene expression data analysis
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Analysis tools for the interplay between genome layout and regulation
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Integrating transcriptional activity in genome-scale models of metabolism
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GREAT: a web portal for Genome Regulatory Architecture Tools
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PreCisIon: PREdiction of CIS-regulatory elements improved by gene's positION
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