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iSPOT: a web tool to infer the interaction specificity of families of protein modules
von
Brannetti, Barbara
,
Helmer-Citterich, Manuela
Veröffentlicht in
Nucleic acids research
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2
Protein surface similarities: a survey of methods to describe and compare protein surfaces
von
Via, A
,
Ferrè, F
,
Brannetti, B
,
Helmer-Citterich, M
Veröffentlicht in
Cellular and molecular life sciences : CMLS
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3
A Combined Experimental and Computational Strategy to Define Protein Interaction Networks for Peptide Recognition Modules
von
Amy Hin Yan Tong
,
Drees, Becky
,
Nardelli, Giuliano
,
Bader, Gary D.
,
Brannetti, Barbara
,
Castagnoli, Luisa
,
Evangelista, Marie
,
Ferracuti, Silvia
,
Nelson, Bryce
,
Paoluzi, Serena
,
Quondam, Michele
,
Zucconi, Adriana
,
Christopher W. V. Hogue
,
Fields, Stanley
,
Boone, Charles
,
Cesareni, Gianni
Veröffentlicht in
Science (American Association for the Advancement of Science)
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4
ELM server: a new resource for investigating short functional sites in modular eukaryotic proteins
von
Puntervoll, Pål
,
Linding, Rune
,
Gemünd, Christine
,
Chabanis-Davidson, Sophie
,
Mattingsdal, Morten
,
Cameron, Scott
,
Martin, David M. A.
,
Ausiello, Gabriele
,
Brannetti, Barbara
,
Costantini, Anna
,
Ferrè, Fabrizio
,
Maselli, Vincenza
,
Via, Allegra
,
Cesareni, Gianni
,
Diella, Francesca
,
Superti-Furga, Giulio
,
Wyrwicz, Lucjan
,
Ramu, Chenna
,
McGuigan, Caroline
,
Gudavalli, Rambabu
,
Letunic, Ivica
,
Bork, Peer
,
Rychlewski, Leszek
,
Küster, Bernhard
,
Helmer-Citterich, Manuela
,
Hunter, William N.
,
Aasland, Rein
,
Gibson, Toby J.
Veröffentlicht in
Nucleic acids research
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5
Three-dimensional view of the surface motif associated with the P-loop structure: cis and trans cases of convergent evolution
von
Via, A
,
Ferrè, F
,
Brannetti, B
,
Valencia, A
,
Helmer-Citterich, M
Veröffentlicht in
Journal of molecular biology
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6
Distinct Binding Specificity of the Multiple PDZ Domains of INADL, a Human Protein with Homology to INAD from Drosophila melanogaster
von
Vaccaro, Paola
,
Brannetti, Barbara
,
Montecchi-Palazzi, Luisa
,
Philipp, Stephan
,
Citterich, Manuela Helmer
,
Cesareni, Gianni
,
Dente, Luciana
Veröffentlicht in
The Journal of biological chemistry
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7
SH3-SPOT: an algorithm to predict preferred ligands to different members of the SH3 gene family
von
Brannetti, Barbara
,
Via, Allegra
,
Cestra, Gianluca
,
Cesareni, Gianni
,
Citterich, Manuela Helmer
Veröffentlicht in
Journal of molecular biology
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8
iSPOT: a web tool for the analysis and recognition of protein domain specificity
von
Brannetti, Barbara
,
Zanzoni, Andreas
,
Montecchi-Palazzi, Luisa
,
Cesareni, Gianni
,
Helmer-Citterich, Manuela
Veröffentlicht in
Comparative and functional genomics
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9
ELM server: A new resource for investigating short functional sites in modular eukaryotic proteins
von
Puntervoll, P
,
Linding, R
,
Gemund, C
,
Chabanis-Davidson, S
,
Mattingsdal, M
,
Cameron, S
,
Martin, DM
,
Ausiello, G
,
Brannetti, B
,
Costantini, A
,
Ferre, F
,
Maselli, V
,
Via, A
,
Cesareni, G
,
Diella, F
,
Superti-Furga, G
,
Wyrwicz, L
,
Ramu, C
,
McGuigan, C
,
Gudavalli, R
,
Letunic, I
,
Bork, P
,
Rychlewski, L
,
Kuster, B
,
Helmer-Citterich, M
,
Hunter, WN
,
Aasland, R
,
Gibson, TJ
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10
Development of computational tools for the inference of protein interaction specificity rules and functional annotation using structural information
von
Ferrè, Fabrizio
,
Via, Allegra
,
Ausiello, Gabriele
,
Brannetti, Barbara
,
Zanzoni, Andreas
,
Helmer-Citterich, Manuela
Veröffentlicht in
Comparative and functional genomics
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