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Transposable elements in phytopathogenic Verticillium spp.: insights into genome evolution and inter- and intra-specific diversification
von
Amyotte, Stefan G
,
Tan, Xiaoping
,
Pennerman, Kayla
,
Jimenez-Gasco, Maria del Mar
,
Klosterman, Steven J
,
Ma, Li-Jun
,
Dobinson, Katherine F
,
Veronese, Paola
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BMC genomics
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2
Lifestyle transitions in plant pathogenic Colletotrichum fungi deciphered by genome and transcriptome analyses
von
O'Connell, Richard J
,
Thon, Michael R
,
Hacquard, Stéphane
,
Amyotte, Stefan G
,
Kleemann, Jochen
,
Torres, Maria F
,
Damm, Ulrike
,
Buiate, Ester A
,
Epstein, Lynn
,
Alkan, Noam
,
Altmüller, Janine
,
Alvarado-Balderrama, Lucia
,
Bauser, Christopher A
,
Becker, Christian
,
Birren, Bruce W
,
Chen, Zehua
,
Choi, Jaeyoung
,
Crouch, Jo Anne
,
Duvick, Jonathan P
,
Farman, Mark A
,
Gan, Pamela
,
Heiman, David
,
Henrissat, Bernard
,
Howard, Richard J
,
Kabbage, Mehdi
,
Koch, Christian
,
Kracher, Barbara
,
Kubo, Yasuyuki
,
Law, Audrey D
,
Lebrun, Marc-Henri
,
Lee, Yong-Hwan
,
Miyara, Itay
,
Moore, Neil
,
Neumann, Ulla
,
Nordström, Karl
,
Panaccione, Daniel G
,
Panstruga, Ralph
,
Place, Michael
,
Proctor, Robert H
,
Prusky, Dov
,
Rech, Gabriel
,
Reinhardt, Richard
,
Rollins, Jeffrey A
,
Rounsley, Steve
,
Schardl, Christopher L
,
Schwartz, David C
,
Shenoy, Narmada
,
Shirasu, Ken
,
Sikhakolli, Usha R
,
Stüber, Kurt
,
Sukno, Serenella A
,
Sweigard, James A
,
Takano, Yoshitaka
,
Takahara, Hiroyuki
,
Trail, Frances
,
van der Does, H Charlotte
,
Voll, Lars M
,
Will, Isa
,
Young, Sarah
,
Zeng, Qiandong
,
Zhang, Jingze
,
Zhou, Shiguo
,
Dickman, Martin B
,
Schulze-Lefert, Paul
,
Ver Loren van Themaat, Emiel
,
Ma, Li-Jun
,
Vaillancourt, Lisa J
Veröffentlicht in
Nature genetics
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3
Comparative genomics yields insights into niche adaptation of plant vascular wilt pathogens
von
Klosterman, Steven J
,
Subbarao, Krishna V
,
Kang, Seogchan
,
Veronese, Paola
,
Gold, Scott E
,
Thomma, Bart P H J
,
Chen, Zehua
,
Henrissat, Bernard
,
Lee, Yong-Hwan
,
Park, Jongsun
,
Garcia-Pedrajas, Maria D
,
Barbara, Dez J
,
Anchieta, Amy
,
de Jonge, Ronnie
,
Santhanam, Parthasarathy
,
Maruthachalam, Karunakaran
,
Atallah, Zahi
,
Amyotte, Stefan G
,
Paz, Zahi
,
Inderbitzin, Patrik
,
Hayes, Ryan J
,
Heiman, David I
,
Young, Sarah
,
Zeng, Qiandong
,
Engels, Reinhard
,
Galagan, James
,
Cuomo, Christina A
,
Dobinson, Katherine F
,
Ma, Li-Jun
Veröffentlicht in
PLoS pathogens
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4
Colonization process of olive tissues by Verticillium dahliae and its in planta interaction with the biocontrol root endophyte Pseudomonas fluorescens PICF7
von
Prieto, Pilar
,
Navarro-Raya, Carmen
,
Valverde-Corredor, Antonio
,
Amyotte, Stefan G.
,
Dobinson, Katherine F.
,
Mercado-Blanco, Jesús
Veröffentlicht in
Microbial biotechnology
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5
Microsclerotia development in Verticillium dahliae: Regulation and differential expression of the hydrophobin gene VDH1
von
Klimes, Anna
,
Amyotte, Stefan G.
,
Grant, Sandra
,
Kang, Seogchan
,
Dobinson, Katherine F.
Veröffentlicht in
Fungal genetics and biology
Volltext
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6
Plant-symbiotic fungi as chemical engineers: multi-genome analysis of the clavicipitaceae reveals dynamics of alkaloid loci
von
Schardl, Christopher L
,
Young, Carolyn A
,
Hesse, Uljana
,
Amyotte, Stefan G
,
Andreeva, Kalina
,
Calie, Patrick J
,
Fleetwood, Damien J
,
Haws, David C
,
Moore, Neil
,
Oeser, Birgitt
,
Panaccione, Daniel G
,
Schweri, Kathryn K
,
Voisey, Christine R
,
Farman, Mark L
,
Jaromczyk, Jerzy W
,
Roe, Bruce A
,
O'Sullivan, Donal M
,
Scott, Barry
,
Tudzynski, Paul
,
An, Zhiqiang
,
Arnaoudova, Elissaveta G
,
Bullock, Charles T
,
Charlton, Nikki D
,
Chen, Li
,
Cox, Murray
,
Dinkins, Randy D
,
Florea, Simona
,
Glenn, Anthony E
,
Gordon, Anna
,
Güldener, Ulrich
,
Harris, Daniel R
,
Hollin, Walter
,
Jaromczyk, Jolanta
,
Johnson, Richard D
,
Khan, Anar K
,
Leistner, Eckhard
,
Leuchtmann, Adrian
,
Li, Chunjie
,
Liu, JinGe
,
Liu, Jinze
,
Liu, Miao
,
Mace, Wade
,
Machado, Caroline
,
Nagabhyru, Padmaja
,
Pan, Juan
,
Schmid, Jan
,
Sugawara, Koya
,
Steiner, Ulrike
,
Takach, Johanna E
,
Tanaka, Eiji
,
Webb, Jennifer S
,
Wilson, Ella V
,
Wiseman, Jennifer L
,
Yoshida, Ruriko
,
Zeng, Zheng
Veröffentlicht in
PLoS genetics
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7
Corrigendum to “Microsclerotia development in Verticillium dahliae: Regulation and differential expression of the hydrophobin gene VDH1” [Fungal Genet. Biol. 45 (2008) 1525–1532]...
von
Klimes, Anna
,
Amyotte, Stefan G.
,
Grant, Sandra
,
Kang, Seogchan
,
Dobinson, Katherine F.
Veröffentlicht in
Fungal genetics and biology
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8
Plant-Symbiotic Fungi as Chemical Engineers: Multi-Genome Analysis of the Clavicipitaceae Reveals Dynamics of Alkaloid Loci. e1003323
von
Schardl, Christopher L
,
Young, Carolyn A
,
Hesse, Uljana
,
Amyotte, Stefan G
,
Andreeva, Kalina
,
Calie, Patrick J
,
Fleetwood, Damien J
,
Haws, David C
,
Moore, Neil
,
Oeser, Birgitt
Veröffentlicht in
PLoS genetics
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9
MITEs in the promoters of effector genes allow prediction of novel virulence genes in Fusarium oxysporum
von
Houterman, Petra M
,
Amyotte, Stefan G
,
Boeren, Sjef
,
Schreiver, Ines
,
Chellappan, Biju
,
Schmidt, Sarah M
,
Takken, Frank L. W
,
Ma, Lisong
,
Rep, Martijn
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10
Plant-symbiotic fungi as chemical engineers: multi-genome analysis of the clavicipitaceae reveals dynamics of alkaloid loci
von
Leistner, Eckhard
,
Sugawara, Koya
,
O'Sullivan, Donal M
,
Mace, Wade
,
Takach, Johanna E
,
Cox, Murray
,
Zeng, Zheng
,
Charlton, Nikki D
,
Schmid, Jan
,
Bullock, Charles T
,
Arnaoudova, Elissaveta G
,
Calie, Patrick J
,
Chen, Li
,
Schweri, Kathryn K
,
Schardl, Christopher L
,
Haws, David C
,
An, Zhiqiang
,
Hollin, Walter
,
Young, Carolyn A
,
Leuchtmann, Adrian
,
Glenn, Anthony E
,
Webb, Jennifer S
,
Fleetwood, Damien J
,
Tudzynski, Paul
,
Steiner, Ulrike
,
Florea, Simona
,
Voisey, Christine R
,
Li, Chunjie
,
Wilson, Ella V
,
Roe, Bruce A
,
Panaccione, Daniel G
,
Wiseman, Jennifer L
,
Liu, Miao
,
Liu, JinGe
,
Johnson, Richard D
,
Gordon, Anna
,
Pan, Juan
,
Hesse, Uljana
,
Farman, Mark L
,
Harris, Daniel R
,
Nagabhyru, Padmaja
,
Khan, Anar K
,
Güldener, Ulrich
,
Jaromczyk, Jerzy W
,
Yoshida, Ruriko
,
Dinkins, Randy D
,
Liu, Jinze
,
Jaromczyk, Jolanta
,
Andreeva, Kalina
,
Amyotte, Stefan G
,
Scott, Barry
,
Machado, Caroline
,
Moore, Neil
,
Tanaka, Eiji
,
Oeser, Birgitt
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11
Plant-Symbiotic Fungi as Chemical Engineers: Multi-Genome Analysis of the Clavicipitaceae Reveals Dynamics of Alkaloid Loci
von
Schardl, Christopher L
,
Young, Carolyn A
,
Hesse, Uljana
,
Amyotte, Stefan G
,
Andreeva, Kalina
,
Calie, Patrick J
,
Fleetwood, Damien J
,
Haws, David C
,
Moore, Neil
,
Oeser, Birgitt
,
Panaccione, Daniel G
,
Schweri, Kathryn K
,
Voisey, Christine R
,
Farman, Mark L
,
Jaromczyk, Jerzy W
,
Roe, Bruce A
,
O'Sullivan, Donal M
,
Scott, Barry
,
Tudzynski, Paul
,
An, Zhiqiang
,
Arnaoudova, Elissaveta G
,
Bullock, Charles T
,
Charlton, Nikki D
,
Chen, Li
,
Cox, Murray
,
Dinkins, Randy D
,
Florea, Simona
,
Glenn, Anthony E
,
Gordon, Anna
,
Güldener, Ulrich
,
Harris, Daniel R
,
Hollin, Walter
,
Jaromczyk, Jolanta
,
Johnson, Richard D
,
Khan, Anar K
,
Leistner, Eckhard
,
Leuchtmann, Adrian
,
Li, Chunjie
,
Liu, JinGe
,
Liu, Jinze
,
Liu, Miao
,
Mace, Wade
,
Machado, Caroline
,
Nagabhyru, Padmaja
,
Pan, Juan
,
Schmid, Jan
,
Sugawara, Koya
,
Steiner, Ulrike
,
Takach, Johanna E
,
Tanaka, Eiji
,
Webb, Jennifer S
,
Wilson, Ella V
,
Wiseman, Jennifer L
,
Yoshida, Ruriko
,
Zeng, Zheng
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Plant-Symbiotic Fungi as Chemical Engineers: Multi-Genome Analysis of the Clavicipitaceae Reveals Dynamics of Alkaloid Loci
von
Christopher L. Schardl
,
Carolyn A. Young
,
Uljana Hesse
,
Stefan G. Amyotte
,
Kalina Andreeva
,
Patrick J. Calie
,
Damien J. Fleetwood
,
David C. Haws
,
Neil Moore
,
Birgitt Oeser
,
Daniel G. Panaccione
,
Kathryn K. Schweri
,
Christine R. Voisey
,
Mark L. Farman
,
Jerzy W. Jaromczyk
,
Bruce A. Roe
,
Donal M. O'Sullivan
,
Barry Scott
,
Paul Tudzynski
,
Zhiqiang An
,
Elissaveta G. Arnaoudova
,
Charles T. Bullock
,
Nikki D. Charlton
,
Li Chen
,
Murray Cox
,
Randy D. Dinkins
,
Simona Florea
,
Anthony E. Glenn
,
Anna Gordon
,
Ulrich Güldener
,
Daniel R. Harris
,
Walter Hollin
,
Jolanta Jaromczyk
,
Richard D. Johnson
,
Anar K. Khan
,
Eckhard Leistner
,
Adrian Leuchtmann
,
Chunjie Li
,
JinGe Liu
,
Jinze Liu
,
Miao Liu
,
Wade Mace
,
Caroline Machado
,
Padmaja Nagabhyru
,
Juan Pan
,
Jan Schmid
,
Koya Sugawara
,
Ulrike Steiner
,
Johanna E. Takach
,
Eiji Tanaka
,
Jennifer S. Webb
,
Ella V. Wilson
,
Jennifer L. Wiseman
,
Ruriko Yoshida
,
Zheng Zeng
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